RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)L

tS(GCU)L, Transcript of Asparagine tRNA (tRNA-Asn), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tS(GCU)L, Length 80 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)LtS(GCU)L CPA2P03965 1118 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L DSS4P32601 143 aa9.56□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L PDR3P33200 976 aa9.56□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L STS1P38637 319 aa9.56□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L FHL1P39521 936 aa9.56□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L DSE1P40077 573 aa9.56□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L VPS70P47161 811 aa9.56□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L YPL014WQ02606 381 aa9.56□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L TFB1P32776 642 aa9.55□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L AVT2P39981 480 aa9.55□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L ERG10P41338 398 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L YJR054WP47114 497 aa9.55□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L NUP84P52891 726 aa9.55□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L YNR065CP53751 1116 aa9.55□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L RLP24Q07915 199 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L RGP1P16664 663 aa9.54□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L DAL1P32375 460 aa9.54□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L STE5P32917 917 aa9.54□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L MAL33P38157 468 aa9.54□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L SAH1P39954 449 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L TDA7P53882 636 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L MUB1Q03162 620 aa9.54□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L TSR1Q07381 788 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L MED1Q12321 566 aa9.54□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L TRK2P28584 889 aa9.53□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L BMH1P29311 267 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L HIR1P32479 840 aa9.53□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L SWI3P32591 825 aa9.53□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L PIK1P39104 1066 aa9.53□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L GDH3P39708 457 aa9.53□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L HEM14P40012 539 aa9.53□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L CSF1Q12150 2958 aa9.53□□□□□ -0.88
tS(GCU)LtS(GCU)L GAL10P04397 699 aa9.52□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L HSF1P10961 833 aa9.52□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L YKL023WP36103 277 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L UTH1P36135 365 aa9.52□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L GUF1P46943 645 aa9.52□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L TIM8P57744 87 aa9.52□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L YAT1P80235 687 aa9.52□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L MTD1Q02046 320 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L RGR1P19263 1082 aa9.51□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L RNR1P21524 888 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L SAP190P36123 1033 aa9.51□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L PPX1P38698 397 aa9.51□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L GEM1P39722 662 aa9.51□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L NBP2Q12163 236 aa9.51□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L CHS2P14180 963 aa9.5□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L COX11P19516 300 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L GUT1P32190 709 aa9.5□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L MLH2Q07980 695 aa9.5□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L ABP140Q08641 628 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L LPX1Q12405 387 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L GCN1P33892 2672 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L IME1P21190 360 aa9.49□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L HSP78P33416 811 aa9.49□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L TBF1Q02457 562 aa9.49□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L OPT2Q06593 877 aa9.49□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L SAM3Q08986 587 aa9.49□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L MSF1P08425 469 aa9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L RRT12P25381 491 aa9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L CCR4P31384 837 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L EFB1P32471 206 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L SRX1P36077 127 aa9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L ECM13P38195 257 aa9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L BAT1P38891 393 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L DUN1P39009 513 aa9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L FLC3P53121 802 aa9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L PSR2Q07949 397 aa9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L SPO21Q12411 609 aa9.48□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L CDC42P19073 191 aa9.47□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L SAT4P25333 603 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L OCA5P38738 679 aa9.47□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L COQ6P53318 479 aa9.47□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L SMA1Q02651 245 aa9.47□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L RTN1Q04947 295 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L HEL2Q05580 639 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L APC5Q08683 685 aa9.47□□□□□ -0.89
tS(GCU)LtS(GCU)L VBA3P25594 458 aa9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L PRX1P34227 261 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L VBA5P36172 582 aa9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L LEU5P38702 357 aa9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L WSC4P38739 605 aa9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L YER158CP40095 573 aa9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L YJR061WP40355 935 aa9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L RGA2Q06407 1009 aa9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L YOR387CQ08910 206 aa9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L LCB4Q12246 624 aa9.46□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data9.45□□□□□ -0.9not detected
tS(GCU)LtS(GCU)L SGE1P33335 543 aa9.45□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L STE13P33894 931 aa9.45□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L NOP4P37838 685 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L SSP1P38871 571 aa9.45□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L UFE1P41834 346 aa9.45□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L STE20Q03497 939 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
tS(GCU)LtS(GCU)L MAK16P10962 306 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
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