RNA–Protein interactions for RNA: YOR238W

YOR238W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YOR238W, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR238W	YOR238W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	PPZ2	P33329	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	MNN4	P36044	1178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	YHR112C	P38716	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	TDA3	P38758	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	FMP52	P40008	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	MGS1	P40151	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	YAP1802	P53309	568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	SSL2	Q00578	843 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	SGO1	Q08490	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	NUP145	P49687	1317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	SEC15	P22224	910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	BCD1	P38772	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	UBC11	P52492	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	DOS2	P54858	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	THI73	Q07904	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	CKB2	P38930	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	NUP60	P39705	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	HOS4	P40480	1083 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	BAP3	P41815	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	YJR142W	P47173	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	TEL2	P53038	688 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	YGL081W	P53156	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	TOP1	P04786	769 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	RET2	P43621	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	UME1	Q03010	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YOR238W	YOR238W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YOR238W	YOR238W	DMC1	P25453	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	YHR202W	P38887	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	YGR153W	P48238	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	MTL1	P53214	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	ARP4	P80428	489 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	HFD1	Q04458	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR238W	YOR238W	SFB3	P38810	929 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	FMO1	P38866	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	YJR096W	P47137	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	YGR237C	P50089	785 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	GID8	P40208	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	TAH11	P47112	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	VHS3	Q08438	674 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	DCS2	Q12123	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	ECM3	Q99252	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	ABF1	P14164	731 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	PEX1	P24004	1043 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	HIR1	P32479	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	PIG2	P40187	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	YIL166C	P40445	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	SUT2	Q12286	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	BNR1	P40450	1375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	KIN82	P25341	720 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	YJL206C	P39529	758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	ARG2	P40360	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	SIR3	P06701	978 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	SPO11	P23179	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	NTH1	P32356	751 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	PET127	P32606	800 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	PHO11	P35842	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	PHO12	P38693	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	LYS9	P38999	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	GET2	P40056	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	CTR1	P49573	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YOR238W	YOR238W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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