RNA–Protein interactions for RNA: YMR308C

PSE1, Transcript of Karyopherin/importin that interacts with the nuclear pore complex, yeast

Gene PSE1, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSE1	YMR308C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	PHO11	P35842	467 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	PHO12	P38693	467 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	BUD16	P39988	312 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YER186C	P40101	306 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	MAD3	P47074	515 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TBF1	Q02457	562 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RMI1	Q02685	241 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TRE2	Q08693	809 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	BI4	P03879	638 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	OXP1	P28273	1286 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	ATO2	P32907	282 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	MMS4	P38257	691 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	FLC2	P39719	783 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	STL1	P39932	569 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TED1	P40533	473 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RTS2	P40962	232 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	PIP2	P52960	996 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	DAP2	P18962	818 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	SMI1	P32566	505 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	SQT1	P35184	431 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	BMT2	P38278	337 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	MLC1	P53141	149 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TFB2	Q02939	513 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YFT2	Q06676	274 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	SIL1	Q08199	421 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	DSE3	Q08729	430 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	VIK1	Q12045	647 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YDL109C	Q12103	647 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	SPO21	Q12411	609 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RFC5	P38251	354 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	FTH1	P38310	465 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	FYV10	P40492	516 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	MDJ2	P42834	146 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TOF1	P53840	1238 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YEH2	Q07950	538 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YPR204W	Q08995	1032 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	SCM3	Q12334	223 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YOR019W	Q99248	730 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	PHO3	P24031	467 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	POP7	P38291	140 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	FZO1	P38297	855 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	SOH1	P38633	127 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	FRT2	P39734	528 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	STB1	P42845	420 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	MNT4	P53745	580 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TGS1	Q12052	315 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.16	□□□□□ -1.58	not detected
PSE1	YMR308C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RCY1	P39531	840 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	BBC1	P47068	1157 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TAF4	P50105	388 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RCM1	P53972	490 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	PDR8	Q06149	701 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	GPR1	Q12361	961 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	SMC4	Q12267	1418 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YLR358C	O13565	187 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	APL1	P27351	700 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	CHS3	P29465	1165 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	HEL1	P36113	551 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	PCH2	P38126	564 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	BRE2	P43132	505 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	PCL10	P53124	433 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YAP1802	P53309	568 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YNR068C	P53754	272 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	THI3	Q07471	609 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	ICL2	Q12031	575 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	AEP3	Q12089	606 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	YPR022C	Q12139	1133 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	NMT1	P14743	455 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	MSN4	P33749	630 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PSE1	YMR308C	TPO5	P36029	618 aa		5.15	□□□□□ -1.58

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