RNA–Protein interactions for RNA: YMR250W

GAD1, Transcript of Glutamate decarboxylase, yeast

Gene GAD1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAD1	YMR250W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CDC42	P19073	191 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	BUD2	P33314	1104 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TBS1	P38114	1094 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	UBX7	P38349	436 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YHL026C	P38740	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	BRL1	P38770	471 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YHR054C	P38780	354 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	FIR1	P40020	876 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	STU2	P46675	888 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	DAS1	P47005	663 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	HST3	P53687	447 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PPM1	Q04081	328 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	GIS3	Q12418	502 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ECM3	Q99252	613 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	GAL10	P04397	699 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CIT2	P08679	460 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	RRN6	P32786	894 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	GYP6	P32806	458 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YKL050C	P35736	922 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	EXO5	P38289	585 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YAP1801	P38856	637 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ESL1	P40456	1118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	HXT8	P40886	569 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	STB4	P50104	949 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	FMP30	Q02883	468 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SOV1	Q04748	898 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CDD1	Q06549	142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	CSG2	P35206	410 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	DYS1	P38791	387 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YFL040W	P43562	540 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	ALT1	P52893	592 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	EEB1	Q02891	456 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	AGP2	P38090	596 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	TCD1	P38756	429 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	LAA1	P39526	2014 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	GEM1	P39722	662 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YTA12	P40341	825 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	EFM4	P40516	257 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SPO74	P45819	413 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SPC98	P53540	846 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	JJJ1	P53863	590 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	GYL1	Q04322	720 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	MCM16	Q12262	181 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	CTF3	Q12748	733 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	ADK2	P26364	225 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SRB4	P32569	687 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	CCC2	P38995	1004 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	ZAP1	P47043	880 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YJR054W	P47114	497 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YGR021W	P53212	290 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YGR035C	P53222	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
GAD1	YMR250W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	VAC14	Q06708	880 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	ESC8	Q08119	714 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SIL1	Q08199	421 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	REC8	Q12188	680 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	HIP1	P06775	603 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PBS2	P08018	668 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YER152C	P10356	443 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	ERG11	P10614	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	KAR3	P17119	729 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	CKI1	P20485	582 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	VPS3	P23643	1011 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	CCL1	P37366	393 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	HIS2	P38635	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YEL075C	P39972	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PSY2	P40164	858 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms