RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W VHR1P40522 640 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W URM1P40554 99 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W IES1P43579 692 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ENP2P48234 707 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W GCV2P49095 1034 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W EXG2P52911 562 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ORC3P54790 616 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ROT1Q03691 256 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YPS7Q06325 596 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YOR352WQ08816 343 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W PSF3Q12146 194 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W MSM1P22438 575 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W STE14P32584 239 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ERR3P42222 437 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W IRC5P43610 853 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W MET12P46151 657 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W TAF1P46677 1066 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W IML2P47031 731 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ASI2P53895 289 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W PLB2Q03674 706 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W HLR1Q04429 423 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W VHS3Q08438 674 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SWM1Q12379 170 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ARP7Q12406 477 aa5.45□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YEL076C-AP0CX16 216 aa5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YLR464WP0CX17 216 aa5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W NGG1P32494 702 aa5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W MSS4P38994 779 aa5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YEL076CP39971 216 aa5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SCS2P40075 244 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W RPT2P40327 437 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W MOT3P54785 490 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W PKH1Q03407 766 aa5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SGD1Q06132 899 aa5.44□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W TRP3P00937 484 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W HIS5P07172 385 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data5.43□□□□□ -1.54not detected
YKR047WYKR047W MF(ALPHA)2P32435 120 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W RPN12P32496 274 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W TGL1P34163 548 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W LRG1P35688 1017 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W GID8P40208 455 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W GTR1Q00582 310 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W BLS1Q06071 122 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W STP4Q07351 490 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SGO1Q08490 590 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W KCS1Q12494 1050 aa5.43□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YLR415CO13578 112 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ADE2P21264 571 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SEC21P32074 935 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W PET127P32606 800 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W BEM3P32873 1128 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W APT2P36973 181 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W PUS4P48567 403 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W UBA2P52488 636 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SNO2P53823 222 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W MED7Q08278 222 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SSP2Q08646 371 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W MCH5Q08777 521 aa5.42□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W TUB3P09734 445 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W FRS1P15624 595 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W PRP4P20053 465 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W GFD2P25370 566 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YKR073CP36153 106 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W APM3P38153 483 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YHR033WP38690 423 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W LAM1P38851 1228 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ICP55P40051 511 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W MAD3P47074 515 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W NCS6P53088 359 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W COX18P53239 316 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ARG5,6Q01217 863 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W TRS130Q03660 1102 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W CIA1Q05583 330 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W GPB1Q08886 897 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YDL177CQ12257 170 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SSM4P40318 1319 aa5.41□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ADH4P10127 382 aa5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W CBP3P21560 335 aa5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W EMC1P25574 760 aa5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W APL2P36000 726 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SHM2P37291 469 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W TOS1P38288 455 aa5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W YBR259WP38338 688 aa5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SIC1P38634 284 aa5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SSP120P39931 234 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W CHA4P43634 648 aa5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W REC102Q02721 264 aa5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W HMI1Q12039 706 aa5.4□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W IME1P21190 360 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MCM10P32354 571 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W TAF5P38129 798 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PSY4P38193 441 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PPE1P38796 400 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W SWD1P39706 426 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.1 ms