RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	SVF1	Q05515	481 aa		1.83	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	ENV7	Q12003	364 aa		1.83	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	TOP3	P13099	656 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	DAL7	P21826	554 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	PET10	P36139	283 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SAK1	P38990	1142 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	NRG1	Q03125	231 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SLM3	Q12093	417 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	HBN1	Q96VH4	193 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	YCL002C	P25565	263 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	TAH11	P47112	604 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	PRC1	P00729	532 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	RAD4	P14736	754 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	KIN3	P22209	435 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SAP190	P36123	1033 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	EAF1	Q06337	982 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	AUS1	Q08409	1394 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	MDM10	P18409	493 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	ARE1	P25628	610 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	PFA3	P42836	336 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	ASM4	Q05166	528 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	TGL5	Q12043	749 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	YLR415C	O13578	112 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	CDC43	P18898	376 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	TAF5	P38129	798 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	YIR042C	P40586	236 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SNM1	P40993	198 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	TAD1	P53065	400 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	NDJ1	Q12366	352 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	YLR278C	Q05854	1341 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	NGG1	P32494	702 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	NIT3	P49954	291 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	AMA1	P50082	593 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	IOC4	Q04213	475 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	EAF6	P47128	113 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	RSC3	Q06639	885 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	FLO10	P36170	1169 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	GYP8	P43570	497 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	ERP6	P53198	216 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	IMO32	P53219	342 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SPO75	Q07798	868 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	1.8	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	EMC3	P36039	253 aa		1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	BCD1	P38772	366 aa		1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SGO1	Q08490	590 aa		1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	OSH2	Q12451	1283 aa		1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	1.79	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	CTT1	P06115	562 aa		1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	HOS4	P40480	1083 aa		1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SSL2	Q00578	843 aa		1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	THI7	Q05998	598 aa		1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	SIC1	P38634	284 aa		1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	TEL2	P53038	688 aa		1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	1.78	□□□□□ -2.12
TTI1	YKL033W	CIT1	P00890	479 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	ADY2	P25613	283 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	ESL2	P36168	1195 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	YJL206C	P39529	758 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	FMP52	P40008	231 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	YIL166C	P40445	542 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	SHR5	P41912	237 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	TIM54	P47045	478 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	UBC11	P52492	156 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	ARO10	Q06408	635 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	THI21	Q08975	551 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	DMC1	P25453	334 aa		1.77	□□□□□ -2.13
TTI1	YKL033W	HIR1	P32479	840 aa		1.77	□□□□□ -2.13

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