RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	ASM4	Q05166	528 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YDR338C	Q05497	695 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.34	□□□□□ -2.03	not detected
YJL135W	YJL135W	PEX1	P24004	1043 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	SEC6	P32844	805 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YKR018C	P36114	725 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	GLG1	P36143	616 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YHR112C	P38716	378 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	OCA5	P38738	679 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	NUP60	P39705	539 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	BUD6	P41697	788 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	SHR5	P41912	237 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	ALY2	P47029	1046 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	ORC4	P54791	529 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	UGO1	Q03327	502 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YOL098C	Q12496	1037 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	GSY1	P23337	708 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	PRP28	P23394	588 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	UBS1	P38290	277 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	LYS9	P38999	446 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	CTR1	P49573	406 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	YOR131C	Q12486	218 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	MSH2	P25847	964 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	HOG1	P32485	435 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	HSL7	P38274	827 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	FMO1	P38866	432 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	NUP1	P20676	1076 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	MIH1	P23748	554 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	YPT7	P32939	208 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	BIT2	P38346	545 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	PCL10	P53124	433 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	MTL1	P53214	551 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	NHX1	Q04121	633 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	YLR125W	Q12138	136 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	CDC9	P04819	755 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	ABF1	P14164	731 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	YFL052W	P43551	465 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	NPY1	P53164	384 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	STP1	Q00947	519 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	THI22	Q06490	572 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	ZRT2	Q12436	422 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	CIT2	P08679	460 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	SRD1	P09007	221 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	FUB1	P25659	250 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	PHO11	P35842	467 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	GMH1	P36125	273 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	PHO12	P38693	467 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	MUP3	P38734	546 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	GET2	P40056	285 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	OSW7	P43611	510 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	IRC8	P47046	822 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	YJR039W	P47107	1121 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	APN1	P22936	367 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	PCL2	P25693	308 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	PEX6	P33760	1030 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.28	□□□□□ -2.04	not detected
YJL135W	YJL135W	APN2	P38207	520 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	SFB3	P38810	929 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	PIG2	P40187	538 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	NUP82	P40368	713 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	MLH3	Q12083	715 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YJL135W	YJL135W	ERR1	P0CX10	437 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	ERR2	P0CX11	437 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	RAD18	P10862	487 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	PHO8	P11491	566 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	KCC4	P25389	1037 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	BCS1	P32839	456 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	YKR051W	P36142	418 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	CTP1	P38152	299 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	MAL31	P38156	614 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	BEM4	P39011	633 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	ARP4	P80428	489 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YJL135W	YJL135W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05

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