RNA–Protein interactions for RNA: YHR067W

HTD2, Transcript of Mitochondrial 3-hydroxyacyl-thioester dehydratase, yeast

Gene HTD2, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTD2	YHR067W	YNL195C	P40168	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	BAP3	P41815	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	COX18	P53239	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	ECM9	Q02202	377 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	PPS1	P38148	807 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	BCD1	P38772	366 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	BEM4	P39011	633 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	BFA1	P47113	574 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	HXT7	P39004	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	GET2	P40056	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	SLI1	P53304	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	ECM3	Q99252	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HTD2	YHR067W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	FMO1	P38866	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	UBC11	P52492	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	YHM2	Q04013	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	SGO1	Q08490	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	PNS1	Q12412	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	SWI6	P09959	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	SEC65	P29478	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	YKU70	P32807	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	NUP60	P39705	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	VHS3	Q08438	674 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	EUG1	P32474	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	HIR1	P32479	840 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	OAF3	P36023	863 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	DID4	P36108	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	FMP52	P40008	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	CTF4	Q01454	927 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	MUK1	Q02866	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	OMS1	Q06668	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	VPS36	Q06696	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	HFI1	Q12060	488 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	TMA17	Q12513	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	PEX1	P24004	1043 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	DAL3	P32459	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	REV7	P38927	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	YJR120W	P47157	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	YPS7	Q06325	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	PET127	P32606	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	FAT1	P38225	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	SFB3	P38810	929 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
HTD2	YHR067W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	DAS1	P47005	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	THI22	Q06490	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	ACF2	Q12168	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	APM4	Q99186	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	SIR3	P06701	978 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	STB4	P50104	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	TEL2	P53038	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	RIA1	P53893	1110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	TRE2	Q08693	809 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HTD2	YHR067W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	IME1	P21190	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	YPT7	P32939	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	MOH1	P38191	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	YBR071W	P38243	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	YHL017W	P38745	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	PCL5	P38794	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	BIT61	P47041	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	STP4	Q07351	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	BCS1	P32839	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	OAR1	P35731	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	PHO11	P35842	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	PAF1	P38351	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HTD2	YHR067W	PHO12	P38693	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.8 ms