RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W SEG1Q04279 960 aa9.67□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W GYL1Q04322 720 aa9.67□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W FPR1P20081 114 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W RNR1P21524 888 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W KIN3P22209 435 aa9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W SCJ1P25303 377 aa9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W DAL1P32375 460 aa9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W EFB1P32471 206 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W ATG12P38316 186 aa9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W AVT2P39981 480 aa9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W VPS70P47161 811 aa9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W TOF2Q02208 771 aa9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W TLG2Q08144 397 aa9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W SAM3Q08986 587 aa9.66□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W RRT12P25381 491 aa9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W GIP1P38229 639 aa9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W FHL1P39521 936 aa9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W RGA2Q06407 1009 aa9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W YCG1Q06680 1035 aa9.65□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W REV1P12689 985 aa9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W COX11P19516 300 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W DSS4P32601 143 aa9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W STE5P32917 917 aa9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W TCD2P36101 447 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W GIP4P39732 760 aa9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W TOS3P43637 560 aa9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W GUF1P46943 645 aa9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W YPL216WQ08964 1102 aa9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W SLX4Q12098 748 aa9.64□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W FAA3P39002 694 aa9.63□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W EAF1Q06337 982 aa9.63□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W NBP2Q12163 236 aa9.63□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W RPC31P17890 251 aa9.62□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W CDC42P19073 191 aa9.62□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W OSW5P40219 148 aa9.62□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W YNR065CP53751 1116 aa9.62□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W STE20Q03497 939 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W YRR1Q12172 810 aa9.62□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W BIK1P11709 440 aa9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W LRE1P25579 583 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W VBA3P25594 458 aa9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W CBF2P32504 956 aa9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W VBA5P36172 582 aa9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W YPT35P38815 214 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W YIR007WP40566 764 aa9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W ERG10P41338 398 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W YPL014WQ02606 381 aa9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W HPF1Q05164 967 aa9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W OM45P16547 393 aa9.6□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W RGR1P19263 1082 aa9.6□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W SAT4P25333 603 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W GDH3P39708 457 aa9.6□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W CPR7P47103 393 aa9.6□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W GUT1P32190 709 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W XRS2P33301 854 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W HSP78P33416 811 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W NOP4P37838 685 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W PPX1P38698 397 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W HEM14P40012 539 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W RSM25P40496 264 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W CDC1P40986 491 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W SBE2P42223 864 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W FIG4P42837 879 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W DDC1Q08949 612 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W YDL206WQ12424 762 aa9.59□□□□□ -0.87
CPD1YGR247W YDL129WQ07555 291 aa9.58□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W BI4P03879 638 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W SAC6P32599 642 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W ECM13P38195 257 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W KIC1P38692 1080 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W CTM1P38818 585 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W SSP1P38871 571 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W PIK1P39104 1066 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W UFE1P41834 346 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W COS5P47187 383 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W PPM1Q04081 328 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W APC5Q08683 685 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W YOR387CQ08910 206 aa9.57□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W MSF1P08425 469 aa9.56□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W NUP84P52891 726 aa9.56□□□□□ -0.88
CPD1YGR247W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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