RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	RTA1	P53047	317 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YGL117W	P53133	265 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	FMP30	Q02883	468 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PEX1	P24004	1043 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	MTC2	P34246	357 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	GMH1	P36125	273 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	BIT2	P38346	545 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	KHA1	P40309	873 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	BNA2	P47125	453 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	TPO2	P53283	614 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	SVF1	Q05515	481 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	IME1	P21190	360 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	TAX4	P47030	604 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RSC3	Q06639	885 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	UBX5	Q06682	500 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PMA2	P19657	947 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	BCS1	P32839	456 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	USV1	Q12132	391 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	KCC4	P25389	1037 aa		0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	HOT13	P36078	116 aa		0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YKR018C	P36114	725 aa		0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YNL018C	P53976	612 aa		0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PRC1	P00729	532 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	STE12	P13574	688 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SCT1	P32784	759 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PXL1	P36166	706 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ALR2	P43553	858 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MET7	Q08645	548 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YLR111W	Q12528	110 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CDC11	P32458	415 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	EUG1	P32474	517 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YPT10	P38146	199 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CTP1	P38152	299 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YGR151C	P53287	111 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	IZH3	Q07959	543 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ULA1	Q12059	462 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	DCS2	Q12123	353 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ZRT2	Q12436	422 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MDS3	P53094	1487 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PRP28	P23394	588 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SAP190	P36123	1033 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	NMD5	P46970	1048 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	NIT3	P49954	291 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SPC98	P53540	846 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MDM12	Q92328	271 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CAN1	P04817	590 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YKR051W	P36142	418 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MAF1	P41910	395 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ALG2	P43636	503 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	RFX1	P48743	811 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YBP2	P53169	641 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ERP6	P53198	216 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	RSC9	Q03124	581 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	LAM4	P38800	1345 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PER1	P25625	357 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	GSY2	P27472	705 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	GCS1	P35197	352 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ASK1	P35734	292 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MET30	P39014	640 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YNL195C	P40168	261 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	TDA10	P42938	290 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CAF16	P43569	289 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MPS3	P47069	682 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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