RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0143Q0143 YHR097CP38809 366 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 RTT107P38850 1070 aa1.79□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 ATG36P46983 293 aa1.79□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 YDL086WQ07505 273 aa1.79□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 SBA1P28707 216 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 MGE1P38523 228 aa1.78□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 KRI1P42846 591 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 BUL2Q03758 920 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 LCD1Q04377 747 aa1.78□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 HRP1Q99383 534 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
Q0143Q0143 FMP46P36141 133 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 AZF1P41696 914 aa1.77□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 FCP1Q03254 732 aa1.77□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 DAL7P21826 554 aa1.76□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 ERG6P25087 383 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 SEC20P28791 383 aa1.76□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 APL3P38065 1025 aa1.76□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 LYS20P48570 428 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YGL117WP53133 265 aa1.76□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YDR179W-AQ03983 463 aa1.76□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 ADE2P21264 571 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 PCA1P38360 1216 aa1.75□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 FYV10P40492 516 aa1.75□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 TPO2P53283 614 aa1.75□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 NGL2Q03264 515 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 THI21Q08975 551 aa1.75□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 PET112P33893 541 aa1.74□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 APL2P36000 726 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YMR230W-AQ3E7B5 62 aa1.74□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YER190C-BP0CX94 160 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YEL077W-AP0CX95 160 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YGR296C-BP0CX96 160 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YPL283W-BP0CX97 160 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YPR204C-AP0CX98 160 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 AGP1P25376 633 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YCL002CP25565 263 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 APD1P38281 316 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 SSF1P38789 453 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YIL024CP40543 189 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 LRS4Q04087 347 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YMR317WQ04893 1140 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 BSC6Q08280 497 aa1.73□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 APT2P36973 181 aa1.72□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 IPL1P38991 367 aa1.72□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 DHH1P39517 506 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 GET2P40056 285 aa1.72□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 CPR8P53728 308 aa1.72□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 ENV7Q12003 364 aa1.72□□□□□ -2.13
Q0143Q0143 YEL076C-AP0CX16 216 aa1.71□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YLR464WP0CX17 216 aa1.71□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YEL076CP39971 216 aa1.71□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 UBP7P40453 1071 aa1.71□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 RKI1Q12189 258 aa1.71□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 HEM1P09950 548 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YMR085WP0CF18 432 aa1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 SAN1P22470 610 aa1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YCP4P25349 247 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 VBA5P36172 582 aa1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 MTG2P38860 518 aa1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 TAD1P53065 400 aa1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 ARG5,6Q01217 863 aa1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 ADD37Q03233 198 aa1.7□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 LEU2P04173 364 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 PEX1P24004 1043 aa1.69□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 SET5P38890 526 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 NIT3P49954 291 aa1.69□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 DIP5P53388 608 aa1.69□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 MCM21Q06675 368 aa1.69□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 AQY1P0CD91 305 aa1.68□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 PMA2P19657 947 aa1.68□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 PRP28P23394 588 aa1.68□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 OPT1P40897 799 aa1.68□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 BST1P43571 1029 aa1.68□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 RMD1Q03441 430 aa1.68□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP1.68□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 AIM44Q99299 758 aa1.68□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 RAD18P10862 487 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YCR043CP25361 127 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 BCS1P32839 456 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 RPC34P32910 317 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 CTP1P38152 299 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 PIG2P40187 538 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YJL043WP47053 257 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 ZIP2P53061 704 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 BOP3P53958 396 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 RSA1Q08932 381 aa1.67□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data1.67□□□□□ -2.14not detected
Q0143Q0143 REV1P12689 985 aa1.66□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 TIF3P34167 436 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YIR016WP40572 265 aa1.66□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 MDV1P47025 714 aa1.66□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 MPS3P47069 682 aa1.66□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YJR107WP47145 328 aa1.66□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 CHS5Q12114 671 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 YPR071WQ12346 211 aa1.66□□□□□ -2.14
Q0143Q0143 RNR1P21524 888 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
Q0143Q0143 BIT2P38346 545 aa1.65□□□□□ -2.15
Q0143Q0143 CFD1P40558 293 aa1.65□□□□□ -2.15
Q0143Q0143 HSL7P38274 827 aa1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.7 ms