RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFIBO00712 420 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHA2P01877 340 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC27P30260 824 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 IDH3AP50213 366 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARSDP51689 593 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUSP27Q5VZP5 1158 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZSWIM9Q86XI8 627 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 NGLY1Q96IV0 654 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 RUSC1Q9BVN2 902 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 LACRTQ9GZZ8 138 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 BCS1LQ9Y276 419 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 SOX18P35713 384 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP10-2P60368 255 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 BNIP3Q12983 259 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNMB1Q16558 191 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 PI4K2BQ8TCG2 481 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHDC7BQ96G42 594 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 KDM4CQ9H3R0 1056 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC31BQ9NQW1 1179 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPIPB6E9PJ23 425 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUV39H1O43463 412 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMP20O60882 483 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT1P04264 644 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD8BP10966 210 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYN1P17600 705 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP11P51784 963 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP27A1Q02318 531 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP135Q66GS9 1140 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 CIAPIN1Q6FI81 312 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 STAG2Q8N3U4 1231 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 BANK1Q8NDB2 785 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBLIM1Q8WUP2 373 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 MISP3Q96FF7 219 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 BORCS6Q96GS4 357 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 C21orf2O43822 256 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 EGFRP00533 1210 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 NLRP12P59046 1061 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUTM2GQ5VZR2 741 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDPF1Q6NVV7 123 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF765Q7L2R6 523 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 FLAD1Q8NFF5 587 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 GATA6Q92908 595 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIK3CDO00329 1044 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 XYLBO75191 536 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIAF1O95411 115 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPHA1P21709 976 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP11AP98196 1134 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFKB2Q00653 900 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 VAC14Q08AM6 782 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEMA3FQ13275 785 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNA10Q16322 511 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPCN2Q8NHX9 752 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 YIPF2Q9BWQ6 316 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 GOPCQ9HD26 462 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 PARD6AQ9NPB6 346 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRIM1Q9NZV1 1036 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM177BA6PVY3 158 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 M0R2N6 131 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIP4K2BP78356 416 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRF5Q13568 498 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCOA4Q13772 614 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR23BQ6ZRT6 265 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 WNT8BQ93098 351 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP4F12Q9HCS2 524 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 OSGEPQ9NPF4 335 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNRKQ9NRH2 765 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLK14Q9P0G3 267 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP20Q9Y2K6 914 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATAD2Q6PL18 1390 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 H3BRJ5 948 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 OVOL3O00110 214 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 OPLAHO14841 1288 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUAK1O60285 661 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 MICAL2O94851 1124 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM253P0C7T8 217 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFIXQ14938 502 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC102BQ68D86 513 aa2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.2 ms