RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU6-170P-201ENST00000362832 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RNU6-170P-201ENST00000362832 POTEDQ86YR6 584 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXD1Q16676 465 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 MSH5O43196 834 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADRA2BP18089 450 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-170P-201ENST00000362832 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RNU6-170P-201ENST00000362832 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF39Q9H2S5 420 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 POTEHQ6S545 545 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-170P-201ENST00000362832 DSG3P32926 999 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAPN15O75808 1086 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-170P-201ENST00000362832 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCB7O75027 752 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRHP20396 242 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 APLP2Q06481 763 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC4A2P04920 1241 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-170P-201ENST00000362832 HAX1O00165 279 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 AKT1S1Q96B36 256 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLA2Q14181 598 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 EVX2Q03828 476 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 PITPNM1O00562 1244 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 LHX8Q68G74 356 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 OSCARQ8IYS5 282 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 GABBR2O75899 941 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNA4P22459 653 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 POTEIP0CG38 1075 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPDYE6P0CI01 402 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHADLQ6NUI6 762 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-170P-201ENST00000362832 POTEMA6NI47 508 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLCN6P51797 869 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 POTEGQ6S5H5 508 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBLN2P98095 1184 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 OTUD5Q96G74 571 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR29P0C7W0 189 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 SSUH2Q9Y2M2 353 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-170P-201ENST00000362832 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 POTEB2H3BUK9 544 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-170P-201ENST00000362832 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-170P-201ENST00000362832 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAMSTRQ6ZN01 415 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 METRNQ9UJH8 293 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 POTEJP0CG39 1038 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB22O15209 634 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF12Q96QT6 1004 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 C7P10643 843 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC39A7Q92504 469 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCUBE2Q9NQ36 999 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms