RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prr29B1ARI9 187 aa21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cspp1B2RX88 1205 aa21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zkscan7E9PVW1 718 aa21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cops6O88545 324 aa21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lins1Q3U1D0 764 aa21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ubash3aQ3V3E1 624 aa21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdca8Q8BHX3 289 aa21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GptQ8QZR5 496 aa21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cfap58B2RW38 873 aa21.3■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pank2Q3U4S0 443 aa21.3■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pnma3Q8JZW8 466 aa21.3■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TnmdQ9EP64 317 aa21.3■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa21.3■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rgs9O54828 675 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem109Q3UBX0 243 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Foxo4Q9WVH3 505 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tyro3P55144 880 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snx13Q6PHS6 957 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sall1Q9ER74 1322 aa21.29■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm29094F6Q785 221 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim34bJ3QNR8 485 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plbd2Q3TCN2 594 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fsd1Q7TPM6 496 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Alx1Q8C8B0 326 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plcd3Q8K2J0 785 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MthfsQ9D110 203 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp2d34L7N463 504 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prl3d1P18121 224 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif3aP28741 701 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccne2Q9Z238 404 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myh1Q5SX40 1942 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adam1aQ60813 791 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spty2d1Q68FG3 682 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abtb2Q7TQI7 1024 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mx2Q9WVP9 655 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kat6bQ8BRB7 1872 aa21.27■■□□□ 1
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Setdb1O88974 1307 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc112A0AUP1 442 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usp28Q5I043 1051 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nlrp9aQ66X03 949 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zbtb1Q91VL9 713 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bicd2Q921C5 820 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hmgn5Q9JL35 406 aa21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sept1P42209 366 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igflr1Q3U4N7 345 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc38a10Q5I012 1090 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BcanQ61361 883 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ubn2Q80WC1 1314 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf326O88291 580 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Exoc5Q3TPX4 708 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Shisa4Q8CA71 197 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mmel1Q9JLI3 765 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pde8bE9Q4S1 865 aa21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lnx1O70263 728 aa21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cct2P80314 535 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gzf1Q4VBD9 706 aa21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Itga6Q61739 1091 aa21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nme8Q715T0 586 aa21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cfap44E9Q5M6 1843 aa21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LyarQ08288 388 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gse1Q3U3C9 1213 aa21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tulp1Q9Z273 543 aa21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mctp1E9PV86 951 aa21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plekhf1Q3TB82 279 aa21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep55Q8BT07 462 aa21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Naa16Q9DBB4 864 aa21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Osbpl5Q9ER64 874 aa21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Oxsr1Q6P9R2 527 aa21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ubxn4Q8VCH8 506 aa21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plekho1Q9JIY0 408 aa21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cfap99A0A140LIX9 648 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prr5lA2AVJ5 370 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clec11aO88200 328 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Edrf1Q6GQV7 1239 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Odf2lQ9D478 642 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam84aQ9D650 292 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc45Q9Z1X9 566 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hmx1O70218 332 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp7a1Q64505 503 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ttc14Q9CSP9 761 aa21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 121 ms