Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Snx13Q6PHS6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Snx13Q6PHS6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Snx13Q6PHS6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Snx13Q6PHS6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Snx13Q6PHS6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Snx13Q6PHS6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Snx13Q6PHS6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Snx13Q6PHS6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Snx13Q6PHS6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Snx13Q6PHS6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Snx13Q6PHS6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Snx13Q6PHS6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Snx13Q6PHS6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Snx13Q6PHS6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Snx13Q6PHS6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Snx13Q6PHS6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Snx13Q6PHS6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Snx13Q6PHS6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Snx13Q6PHS6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Snx13Q6PHS6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Snx13Q6PHS6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Snx13Q6PHS6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Snx13Q6PHS6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Snx13Q6PHS6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Snx13Q6PHS6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Snx13Q6PHS6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Snx13Q6PHS6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Snx13Q6PHS6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Snx13Q6PHS6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Snx13Q6PHS6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Snx13Q6PHS6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Snx13Q6PHS6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Snx13Q6PHS6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Snx13Q6PHS6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Snx13Q6PHS6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Snx13Q6PHS6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Snx13Q6PHS6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Snx13Q6PHS6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Snx13Q6PHS6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Snx13Q6PHS6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Snx13Q6PHS6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Snx13Q6PHS6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Snx13Q6PHS6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Snx13Q6PHS6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Snx13Q6PHS6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Snx13Q6PHS6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Snx13Q6PHS6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Snx13Q6PHS6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Snx13Q6PHS6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Snx13Q6PHS6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Snx13Q6PHS6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Snx13Q6PHS6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Snx13Q6PHS6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Snx13Q6PHS6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Snx13Q6PHS6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Snx13Q6PHS6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Snx13Q6PHS6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Snx13Q6PHS6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Snx13Q6PHS6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Snx13Q6PHS6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Snx13Q6PHS6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Snx13Q6PHS6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Snx13Q6PHS6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Snx13Q6PHS6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Snx13Q6PHS6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Snx13Q6PHS6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Snx13Q6PHS6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Snx13Q6PHS6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Snx13Q6PHS6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Snx13Q6PHS6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Snx13Q6PHS6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Snx13Q6PHS6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Snx13Q6PHS6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Snx13Q6PHS6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Snx13Q6PHS6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Snx13Q6PHS6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Snx13Q6PHS6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Snx13Q6PHS6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Snx13Q6PHS6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Snx13Q6PHS6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Snx13Q6PHS6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Snx13Q6PHS6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Snx13Q6PHS6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Snx13Q6PHS6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Snx13Q6PHS6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Snx13Q6PHS6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Snx13Q6PHS6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Snx13Q6PHS6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Snx13Q6PHS6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Snx13Q6PHS6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Snx13Q6PHS6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Snx13Q6PHS6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Snx13Q6PHS6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Snx13Q6PHS6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Snx13Q6PHS6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Snx13Q6PHS6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Snx13Q6PHS6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Snx13Q6PHS6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Snx13Q6PHS6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.7 ms