RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TAF11Q15544 211 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GSG1Q2KHT4 349 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 FAHD1Q6P587 224 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZER1Q7Z7L7 766 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OR51F2Q8NH61 342 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MCHR2Q969V1 340 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TMEM186Q96B77 213 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN32Q96QS1 320 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 DOK1Q99704 481 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TXNIPQ9H3M7 391 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RNF121Q9H920 327 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 IL20RAQ9UHF4 553 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CMAHPQ9Y471 501 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ORC6Q9Y5N6 252 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 DYSFO75923 2080 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPL8 197 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 H7C1C5 153 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 M0R233 179 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SYNGR3O43761 229 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MITFO75030 526 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MSMBP08118 114 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PATE4P0C8F1 98 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ACHEP22303 614 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 THBS4P35443 961 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GIPRP48546 466 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RPL27P61353 136 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 LCN6P62502 163 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZBED5Q49AG3 693 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ARMC4Q5T2S8 1044 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 C1orf94Q6P1W5 598 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 LRFN4Q6PJG9 635 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 LRRC18Q8N456 261 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A24Q8N4F4 322 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CLDN22Q8N7P3 220 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF570Q96NI8 536 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SH3GL3Q99963 347 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RIBC2Q9H4K1 309 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NOX3Q9HBY0 568 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TMEM38BQ9NVV0 291 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 HIF1ANQ9NWT6 349 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GRHPRQ9UBQ7 328 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TRAV20A0A0B4J274 112 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 TMEM89A2RUT3 159 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 UNC119BA6NIH7 251 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 A6NIZ1 184 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 XKRYO14609 159 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 UBL3O95164 117 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 NDUFB2O95178 105 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 VENTXO95231 258 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 SNAP29O95721 258 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 ADRA2AP08913 450 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 NR2C1P13056 603 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 CALCRP30988 508 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 IL2RGP31785 369 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 CDAP32320 146 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 RAD23AP54725 363 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 TMEM33P57088 247 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 HILS1P60008 231 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 RAP1BP61224 184 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 RAB1AP62820 205 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 RAP1AP62834 184 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN31Q12999 210 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 SGCAQ16586 387 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 KDM4DQ6B0I6 523 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 KRT80Q6KB66 452 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 SLC16A14Q7RTX9 510 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 SKA3Q8IX90 412 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 FANK1Q8TC84 345 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC9Q8WXX5 260 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 RBP7Q96R05 134 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 GPA33Q99795 319 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 ZNF416Q9BWM5 594 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 SUCNR1Q9BXA5 334 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 DGCR6LQ9BY27 220 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 KCNN2Q9H2S1 579 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 TOR3AQ9H497 397 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 RERGLQ9H628 205 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 GPR160Q9UJ42 338 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 FBXL3Q9UKT7 428 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-210ENST00000442481 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms