RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C BTT1P40314 149 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C GYP8P43570 497 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C ZAP1P47043 880 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C PEX14P53112 341 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C CAF120P53836 1060 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C PEX19Q07418 342 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C TAF10Q12030 206 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C MED1Q12321 566 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C HRT3Q12347 344 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C FUS1P11710 512 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C HOM2P13663 365 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C MTF1P14908 341 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C RAD16P31244 790 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C BCH2P36122 765 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C YKR051WP36142 418 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C SIF2P38262 535 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C SHE3P38272 425 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C NEM1P38757 446 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C FMO1P38866 432 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C IES1P43579 692 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C NPA3P47122 385 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C HER2Q03557 464 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C PSR2Q07949 397 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C YPQ1Q12010 308 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C GIS3Q12418 502 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C MPD2Q99316 277 aa7.55□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C RPC31P17890 251 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C MRM1P25270 412 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C TKL2P33315 681 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data7.54□□□□□ -1.2not detected
SPE3YPR069C AGP2P38090 596 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C TBS1P38114 1094 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C RSM26P47141 266 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C UTP8P53276 713 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C TMN2Q04562 672 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C BSP1Q06604 576 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C YPR084WQ06821 456 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C RLP24Q07915 199 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C GPM2Q12008 311 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C YPR027CQ12079 277 aa7.54□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C MSB2P32334 1306 aa7.53□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C RPL22AP05749 121 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C CHS1P08004 1131 aa7.53□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C GAC1P28006 793 aa7.53□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C FAA4P47912 694 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C ALT1P52893 592 aa7.53□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C YNR061CP53747 219 aa7.53□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C YML053CQ04978 212 aa7.53□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C SIR1P21691 654 aa7.52□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C PPH22P23595 377 aa7.52□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C SCJ1P25303 377 aa7.52□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C SMC3P47037 1230 aa7.52□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C YNL011CP53980 444 aa7.52□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C TIM8P57744 87 aa7.52□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C WAR1Q03631 944 aa7.52□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C CET1O13297 549 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C BIK1P11709 440 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C CDC15P27636 974 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C KIP1P28742 1111 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C YBR056WP38081 501 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C YBL036CP38197 257 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C MED6P38782 295 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C NMD3P38861 518 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C DSE1P40077 573 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C IMP4P53941 290 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C PRM6Q04705 352 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C MLH2Q07980 695 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C FLC1Q08967 793 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C NDJ1Q12366 352 aa7.51□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C CHS2P14180 963 aa7.5□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C SWI3P32591 825 aa7.5□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C FRE1P32791 686 aa7.5□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C YKL023WP36103 277 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C RAD55P38953 406 aa7.5□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C SAH1P39954 449 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C GAL10P04397 699 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C CDC42P19073 191 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C IME1P21190 360 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C RNR1P21524 888 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C GPI10P30777 616 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C YKL091CP33324 310 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C SPT23P35210 1082 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C NUP60P39705 539 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C YIR014WP40570 242 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C CHS6P40955 746 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C FIG4P42837 879 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C YJR054WP47114 497 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C NIS1P53939 407 aa7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C COX11P19516 300 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C GGA2P38817 585 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SPE3YPR069C FHL1P39521 936 aa7.48□□□□□ -1.21
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