RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	DJP1	P40564	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	HNT2	P49775	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	ZIP2	P53061	704 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	HOT1	Q03213	719 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	VID22	Q05934	901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	PUS5	Q06244	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	ESC8	Q08119	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	MET7	Q08645	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	GNT1	Q12096	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	CDC16	P09798	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	NPP1	P25353	742 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	MLS1	P30952	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	EMC3	P36039	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YBR225W	P38321	900 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	NHX1	Q04121	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	OMS1	Q06668	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	GLO4	Q12320	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
TYW1	YPL207W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	CHD1	P32657	1468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YCL049C	P25577	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	DAL1	P32375	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	CBF2	P32504	956 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	SLC1	P33333	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YRO2	P38079	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	NEM1	P38757	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YER010C	P40011	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	ADE8	P04161	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	PER1	P25625	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	NGG1	P32494	702 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	REC104	P33323	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	HSL7	P38274	827 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	HXT16	P47185	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	ENV11	P53246	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	BNI4	P53858	892 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	TIM50	Q02776	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	ENV7	Q12003	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	NUR1	Q12066	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	CBP3	P21560	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	APM3	P38153	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	PNT1	P38969	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	NPR2	P39923	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	MDE1	P47095	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	GUP1	P53154	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	DAM1	P53267	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	CDC25	P04821	1589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	HSF1	P10961	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	PUG1	P40100	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	LTP1	P40347	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	MAD3	P47074	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YNR040W	P53736	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YHM2	Q04013	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	FUS1	P11710	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	CKA1	P15790	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	ADP1	P25371	1049 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YKL077W	P36081	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	ESL2	P36168	1195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	ALG3	P38179	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	RGD1	P38339	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YHR202W	P38887	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	VPS41	P38959	992 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	YIL092W	P40497	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	SLS1	P42900	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	CBK1	P53894	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	ZDS2	P54786	942 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	EAR1	Q03212	550 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	MFB1	Q04922	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	REX3	Q12090	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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