RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	BFA1	P47113	574 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	SGD1	Q06132	899 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	MLC2	Q06580	163 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	GPR1	Q12361	961 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	SEC65	P29478	273 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	YKL133C	P36066	463 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	TOS1	P38288	455 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	IES5	P40060	125 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	CHA4	P43634	648 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	SNO2	P53823	222 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	ATG16	Q03818	150 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	HIS5	P07172	385 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	KCC4	P25389	1037 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
RPS31	YLR167W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	FAT1	P38225	669 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	GID8	P40208	455 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	ASI2	P53895	289 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	PLB2	Q03674	706 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
RPS31	YLR167W	CDC6	P09119	513 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	SED4	P25365	1065 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	RIM4	P38741	713 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	LAM1	P38851	1228 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	PZF1	P39933	429 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	NCS6	P53088	359 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	YGR021W	P53212	290 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	VPS62	P53285	467 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	ORC4	P54791	529 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	HMI1	Q12039	706 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	YKU70	P32807	602 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	YKR075C	P36155	307 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	SAK1	P38990	1142 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	PFA3	P42836	336 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	DUS4	Q06063	367 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS31	YLR167W	APN2	P38207	520 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	YOR352W	Q08816	343 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	GPB1	Q08886	897 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	NGG1	P32494	702 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	SIC1	P38634	284 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.7	□□□□□ -1.5	not detected
RPS31	YLR167W	MEF2	P39677	819 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	ECM1	P39715	212 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	CTH1	P47976	325 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	HOL1	P53389	586 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	VPS72	Q03388	795 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	ROT1	Q03691	256 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	ASM4	Q05166	528 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	YLR407W	Q06070	228 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	YLR415C	O13578	112 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	ATP12	P22135	325 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	PTH2	P34222	208 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	YHR202W	P38887	602 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	VHR1	P40522	640 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	IES1	P43579	692 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	GCN5	Q03330	439 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	YDR132C	Q03900	495 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	RXT3	Q07458	294 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	SWM1	Q12379	170 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	CDC26	P14724	124 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.68	□□□□□ -1.5	not detected
RPS31	YLR167W	HOP1	P20050	605 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	EMC1	P25574	760 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	YBR259W	P38338	688 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	YHL041W	P38730	149 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	VID28	P40547	921 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	GCV2	P49095	1034 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPS31	YLR167W	YBP2	P53169	641 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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