RNA–Protein interactions for RNA: YLL011W

SOF1, Transcript of Protein required for biogenesis of 40S (small) ribosomal subunit, yeast

Gene SOF1, Length 1,470 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOF1	YLL011W	SAW1	P39735	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	RAD26	P40352	1085 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	LEM3	P42838	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SGM1	P47166	707 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	PCL10	P53124	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	HOL1	P53389	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	CRR1	Q05790	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	MDM38	Q08179	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	DIF1	O13577	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	DAL5	P15365	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	PAH1	P32567	862 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SLC1	P33333	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	APM3	P38153	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	MUM2	P38236	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	CCZ1	P38273	704 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	GIC1	P38785	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SPC72	P39723	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	EAF5	P39995	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SMK1	P41808	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SHR5	P41912	237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SGD1	Q06132	899 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	VPS5	Q92331	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SPP41	P38904	1435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	MRP7	P12687	371 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	ERS1	P17261	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YEL068C	P39977	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YKE2	P52553	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SFB2	P53953	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	MCH5	Q08777	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	ARP7	Q12406	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	DPH6	Q12429	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	POL1	P13382	1468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	NGG1	P32494	702 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YKL050C	P35736	922 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SAP190	P36123	1033 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	PPE1	P38796	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	APE4	P38821	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YJL045W	P47052	634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	MAD3	P47074	515 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	ZIP2	P53061	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	ERO1	Q03103	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	DCS2	Q12123	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	FPS1	P23900	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	PEX5	P35056	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YHR202W	P38887	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	AXL2	P38928	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	GIP2	P40036	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	VHR1	P40522	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	TED1	P40533	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YFL052W	P43551	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	BFA1	P47113	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	SRT1	Q03175	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	ARA2	Q04212	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	YKU80	Q04437	629 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	ELG1	Q12050	791 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	TSC11	P40061	1430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOF1	YLL011W	MET8	P15807	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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