RNA–Protein interactions for RNA: YKR062W

TFA2, Transcript of TFIIE small subunit, yeast

Gene TFA2, Length 987 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TFA2	YKR062W	YKR018C	P36114	725 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	DLT1	Q04216	342 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	HFD1	Q04458	532 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	SIC1	P38634	284 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	CKB2	P38930	258 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	FKH2	P41813	862 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	YGR153W	P48238	217 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	GAD1	Q04792	585 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	TRM2	P33753	639 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	MAL31	P38156	614 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	PHO23	P50947	330 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	NTO1	Q12311	748 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	YEN1	P40028	759 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	RET2	P43621	546 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	AMA1	P50082	593 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	ELO3	P40319	345 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	YJR096W	P47137	282 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	MIH1	P23748	554 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	YCR015C	P25616	317 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	KTR4	P38131	464 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	SUL1	P38359	859 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	ECM1	P39715	212 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	AIM21	P40563	679 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	COX18	P53239	316 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	RNT1	Q02555	471 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	ASM4	Q05166	528 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	MCM21	Q06675	368 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	APN2	P38207	520 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	TAF1	P46677	1066 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	REC102	Q02721	264 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TFA2	YKR062W	ERG4	P25340	473 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	MNN4	P36044	1178 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	UBP12	P39538	1254 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	YIR042C	P40586	236 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	SGO1	Q08490	590 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	GRX4	P32642	244 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	MSE1	P48525	536 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	MUP1	P50276	574 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	TGL5	Q12043	749 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	GPR1	Q12361	961 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	LAS17	Q12446	633 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	SEC15	P22224	910 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	DID4	P36108	232 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	YJR039W	P47107	1121 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	MRPS35	P53292	345 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	YHM2	Q04013	314 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	TRE2	Q08693	809 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	FRE5	Q08908	694 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	YHR202W	P38887	602 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	DAS1	P47005	663 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	ARP4	P80428	489 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	TIM44	Q01852	431 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	DCS2	Q12123	353 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	ALG7	P07286	448 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	YHR112C	P38716	378 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	REV7	P38927	245 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	YLR040C	Q07988	224 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TFA2	YKR062W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
TFA2	YKR062W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
TFA2	YKR062W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
TFA2	YKR062W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
TFA2	YKR062W	GPG1	P53130	126 aa		5.58	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.5 ms