RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W GSY1P23337 708 aa4.74□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W APL2P36000 726 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W RRN3P36070 627 aa4.74□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W GDH3P39708 457 aa4.74□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W TGL2P54857 326 aa4.74□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W EEB1Q02891 456 aa4.74□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W SPO21Q12411 609 aa4.74□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W GAL1P04385 528 aa4.73□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W TAF13P11747 167 aa4.73□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W BAP2P38084 609 aa4.73□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W ALR2P43553 858 aa4.73□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W PFD1P46988 109 aa4.73□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W RTA1P53047 317 aa4.73□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W GRC3Q07845 632 aa4.73□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W CDC31P06704 161 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W OSM1P21375 501 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W PLC1P32383 869 aa4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W NIC96P34077 839 aa4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W MUM2P38236 366 aa4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W DSS1P39112 969 aa4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W YFL054CP43549 646 aa4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W GPG1P53130 126 aa4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W PBP1P53297 722 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W YNL034WP53963 612 aa4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W YNL018CP53976 612 aa4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PIR3YKL163W COQ4O13525 335 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W LYP1P32487 611 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W TFC4P33339 1025 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W PEX5P35056 612 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W BET3P36149 193 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W TMA108P40462 946 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W TNA1P53322 534 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W MLC2Q06580 163 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W PSK2Q08217 1101 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W CTI6Q08923 506 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W MDM12Q92328 271 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YLR278CQ05854 1341 aa4.71□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W TRP2P00899 507 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W SNF5P18480 905 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W CHS3P29465 1165 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W MKK2P32491 506 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data4.7□□□□□ -1.66not detected
PIR3YKL163W EXO84P38261 753 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W HXT13P39924 564 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W NDE1P40215 560 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W MNT3P40549 630 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W SAP185P40856 1058 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W CNN1P43618 361 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W IML2P47031 731 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YBP2P53169 641 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W HXT17P53631 564 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W HXT15P54854 567 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YML131WQ03102 365 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W RSB1Q08417 382 aa4.7□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YIL177CP40434 1758 aa4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YJL225CP40889 1758 aa4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W TOM70P07213 617 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W SMY1P32364 656 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W CCZ1P38273 704 aa4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W DUG1P43616 481 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W UBA2P52488 636 aa4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W SIW14P53965 281 aa4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YMR018WQ04364 514 aa4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YLR352WQ06479 807 aa4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W OPY2Q06810 360 aa4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W POM152P39685 1337 aa4.69□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YML133CQ03099 1374 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YLL067CQ07888 1374 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YLL066CQ99208 1374 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W DAL5P15365 543 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W AEP2P22136 580 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W DBF20P32328 564 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W YKL050CP35736 922 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W PFF1P38244 976 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W LAM1P38851 1228 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W CCC2P38995 1004 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W PIK1P39104 1066 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W MGS1P40151 587 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W SEC26P41810 973 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W VTC2P43585 828 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W ENT3P47160 408 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W GNP1P48813 663 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W SPT20P50875 604 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W MAL11P53048 616 aa4.68□□□□□ -1.66
PIR3YKL163W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61.6 ms