RNA–Protein interactions for RNA: YKL056C

TMA19, Transcript of Protein that associates with ribosomes, yeastyeast

Gene TMA19, Length 504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA19YKL056C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SSL2Q00578 843 aa3.81□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C VPS72Q03388 795 aa3.81□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C APC5Q08683 685 aa3.81□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YDL206WQ12424 762 aa3.81□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C CDC33P07260 213 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C PET111P08468 800 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C PDR1P12383 1068 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C MSD1P15179 658 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C POL3P15436 1097 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.8□□□□□ -1.8 RIP-Chip
TMA19YKL056C SEC65P29478 273 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C HXT1P32465 570 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SRB4P32569 687 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C PAM1P37304 830 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C NOP4P37838 685 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C UBP14P38237 781 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C MCX1P38323 520 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YHL026CP38740 315 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YJR054WP47114 497 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C GCV2P49095 1034 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C FOL2P51601 243 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C HOP2P53187 214 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C ALG11P53954 548 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YDR090CQ03193 310 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C STE20Q03497 939 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YDL073WQ07454 984 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YOL075CQ08234 1294 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YPL216WQ08964 1102 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C ATG9Q12142 997 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C OSH2Q12451 1283 aa3.8□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C ECM29P38737 1868 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C PPR1P07272 904 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C ASP3-2P0CX77 362 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C ASP3-3P0CX78 362 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C ASP3-4P0CX79 362 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C ASP3-1P0CZ17 362 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YER152CP10356 443 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C MTF2P10849 440 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C KGD2P19262 463 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C CKI1P20485 582 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C VPS3P23643 1011 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C MET4P32389 672 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C MAC1P35192 417 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C RPC25P35718 212 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C BLI1P35727 113 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C RGD1P38339 666 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C ERC1P38767 581 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SOL3P38858 249 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C MMF1P40185 145 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YTA12P40341 825 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C CPR7P47103 393 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.79□□□□□ -1.8not detected
TMA19YKL056C MUK1Q02866 612 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C UME1Q03010 460 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YMR018WQ04364 514 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SHS1Q07657 551 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C RIF1P29539 1916 aa3.79□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C AI4P03878 556 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C COX4P04037 155 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data3.78□□□□□ -1.8not detected
TMA19YKL056C HAP2P06774 265 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C CDC42P19073 191 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SCJ1P25303 377 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SMC1P32908 1225 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C XRS2P33301 854 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C RRP1P35178 278 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C CSG2P35206 410 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C DRE2P36152 348 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C JNM1P36224 373 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C APN2P38207 520 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C DYS1P38791 387 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YHR202WP38887 602 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C SAH1P39954 449 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YER186CP40101 306 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C ATG3P40344 310 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C EFM4P40516 257 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C STR2P47164 639 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C CLA4P48562 842 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C NUP42P49686 430 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C MAL13P53338 473 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C YNL108CP53929 270 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C TBF1Q02457 562 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C EEB1Q02891 456 aa3.78□□□□□ -1.8
TMA19YKL056C RCR2Q03446 210 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 212.7 ms