RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W UTP8P53276 713 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W TMN2Q04562 672 aa9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W MTF1P14908 341 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W SHE3P38272 425 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W IES1P43579 692 aa9.79□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W NIS1P53939 407 aa9.79□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W IMP4P53941 290 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W HER2Q03557 464 aa9.79□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W COG8Q04632 607 aa9.79□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W DAL7P21826 554 aa9.78□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W KIP1P28742 1111 aa9.78□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W MET4P32389 672 aa9.78□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W MUD1P32605 298 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W TSA1P34760 196 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W SIF2P38262 535 aa9.78□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W YPQ1Q12010 308 aa9.78□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W NAT1P12945 854 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W PPH22P23595 377 aa9.77□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W MSH2P25847 964 aa9.77□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W RAD16P31244 790 aa9.77□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W KDX1P36005 433 aa9.77□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W MAL33P38157 468 aa9.77□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W DAS1P47005 663 aa9.77□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W YKR051WP36142 418 aa9.76□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W FTR1P40088 404 aa9.76□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W CHS6P40955 746 aa9.76□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W WAR1Q03631 944 aa9.76□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W PRM6Q04705 352 aa9.76□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W BSP1Q06604 576 aa9.76□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W GPM2Q12008 311 aa9.76□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W STB3Q12427 513 aa9.76□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W GPI10P30777 616 aa9.75□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W TKL2P33315 681 aa9.75□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data9.75□□□□□ -0.85not detected
CPD1YGR247W SPT23P35210 1082 aa9.75□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W YBR056WP38081 501 aa9.75□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W AGP2P38090 596 aa9.75□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W CWC24P53769 259 aa9.75□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W DON1Q05610 365 aa9.75□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W GAC1P28006 793 aa9.74□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W ALT1P52893 592 aa9.74□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W PSR2Q07949 397 aa9.74□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W PIN2Q12057 282 aa9.74□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W NDJ1Q12366 352 aa9.74□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W CHS1P08004 1131 aa9.73□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W BMH1P29311 267 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W PRX1P34227 261 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W LCB2P40970 561 aa9.73□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W TCO89Q08921 799 aa9.73□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W FLC1Q08967 793 aa9.73□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W YPR027CQ12079 277 aa9.73□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W TRK2P28584 889 aa9.72□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W HIR1P32479 840 aa9.72□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W GGA2P38817 585 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W SMC3P47037 1230 aa9.72□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W PEX14P53112 341 aa9.72□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W MED1Q12321 566 aa9.72□□□□□ -0.85
CPD1YGR247W FRE1P32791 686 aa9.71□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W NUP60P39705 539 aa9.71□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W DOT6P40059 670 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W YNL011CP53980 444 aa9.71□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W VPS20Q04272 221 aa9.71□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W RDS1P25611 832 aa9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W PDC6P26263 563 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W CSE1P33307 960 aa9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W TIM8P57744 87 aa9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W MUB1Q03162 620 aa9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W GCN5Q03330 439 aa9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W MLH2Q07980 695 aa9.7□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W CHS2P14180 963 aa9.69□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W SWE1P32944 819 aa9.69□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W RAD55P38953 406 aa9.69□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W DAN4P47179 1161 aa9.69□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W NMA2P53204 395 aa9.69□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W GIS3Q12418 502 aa9.69□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W IRA2P19158 3079 aa9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W GAL10P04397 699 aa9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W CDC15P27636 974 aa9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W SWI3P32591 825 aa9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W TIF5P38431 405 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W GEM1P39722 662 aa9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W SAH1P39954 449 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W RMD8P43620 662 aa9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W YJR054WP47114 497 aa9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W NPA3P47122 385 aa9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W TBF1Q02457 562 aa9.68□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W IME1P21190 360 aa9.67□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W YBR225WP38321 900 aa9.67□□□□□ -0.86
CPD1YGR247W DSE1P40077 573 aa9.67□□□□□ -0.86
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