RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	PAC10	P48363	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PEP12	P32854	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YKL133C	P36066	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RXT2	P38255	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YBR242W	P38331	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	UBX7	P38349	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MXR1	P40029	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	BRO1	P48582	844 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	FMS1	P50264	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RSC4	Q02206	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	KAR5	Q04746	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	SPR28	Q04921	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PEX6	P33760	1030 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PEX12	Q04370	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	BCH1	Q05029	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	CDC123	Q05791	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	BDS1	Q08347	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	VAM7	P32912	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	COX15	P40086	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MDM36	Q06820	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PEP1	P32319	1579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	VPS15	P22219	1454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	CIT2	P08679	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MTF2	P10849	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	FBP26	P32604	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	APM3	P38153	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MED8	P38304	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	AIM2	P39721	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PCI8	P40512	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	GUP1	P53154	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MCP2	Q06567	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	REC8	Q12188	680 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YME1	P32795	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	VPS35	P34110	944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PAC11	P40960	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YFR006W	P43590	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YGL176C	P46945	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RSM7	P47150	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	CSN9	Q03981	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	QCR7	P00128	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	UBA2	P52488	636 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	SPC105	P53148	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RMT2	Q03305	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	STV1	P37296	890 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	VTH1	P40438	1549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	VTH2	P40890	1549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	HIS5	P07172	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	AXL1	P40851	1208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	TOF1	P53840	1238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	HFD1	Q04458	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	SPC24	Q04477	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	SEC63	P14906	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	AFT1	P22149	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	ITR2	P30606	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RIB7	P33312	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MKS1	P34072	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MTG2	P38860	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PTP3	P40048	928 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	INP52	P50942	1183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PHO81	P17442	1178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	ATP7	P30902	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	SEC66	P33754	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	BDF1	P35817	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	ARV1	Q06541	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PHO8	P11491	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	MDJ1	P35191	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	DAD2	P36162	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	SNX4	P47057	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM10	YFL007W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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