RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W RGA2Q06407 1009 aa9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W OPY2Q06810 360 aa9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SHS1Q07657 551 aa9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W YLR001CQ07895 862 aa9.54□□□□□ -0.88
DDI1YER143W ERG11P10614 530 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W ADE2P21264 571 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W PAH1P32567 862 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W RPT1P33299 467 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W TVP23P38962 199 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W RRD1P40454 393 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W ZAP1P47043 880 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W AZR1P50080 613 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W TBF1Q02457 562 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W MUK1Q02866 612 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W VPS72Q03388 795 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W SML1Q04964 104 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W VAC14Q06708 880 aa9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
DDI1YER143W PET111P08468 800 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ASP3-2P0CX77 362 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ASP3-3P0CX78 362 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ASP3-4P0CX79 362 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ASP3-1P0CZ17 362 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W STE11P23561 717 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W DAL2P25335 343 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YAP1801P38856 637 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YGR021WP53212 290 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W MAM3Q12296 706 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa9.52□□□□□ -0.89
DDI1YER143W CDC33P07260 213 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W COX11P19516 300 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W CKI1P20485 582 aa9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W RNR1P21524 888 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W CSG2P35206 410 aa9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W UIP5P36137 443 aa9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W EXO5P38289 585 aa9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W BUD16P39988 312 aa9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W INP51P40559 946 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W BTN2P53286 410 aa9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ADE4P04046 510 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SNF1P06782 633 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W RRT12P25381 491 aa9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SEC21P32074 935 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W UBX7P38349 436 aa9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ALD5P40047 520 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YER186CP40101 306 aa9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W CEP3P40969 608 aa9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W PHO86P46956 311 aa9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W PUS2P53167 370 aa9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ECM3Q99252 613 aa9.5□□□□□ -0.89
DDI1YER143W RPS3P05750 240 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W RAM1P22007 431 aa9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W PRR1P28708 518 aa9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W CBF2P32504 956 aa9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W TRM2P33753 639 aa9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YKL050CP35736 922 aa9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W DYS1P38791 387 aa9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ISM1P48526 1002 aa9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa9.49□□□□□ -0.89
DDI1YER143W PAP1P29468 568 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SRB4P32569 687 aa9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W LDH1P38139 375 aa9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YHR054CP38780 354 aa9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SAH1P39954 449 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YTA12P40341 825 aa9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W NDC80P40460 691 aa9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W STE20Q03497 939 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W POB3Q04636 552 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W PCD1Q12524 340 aa9.48□□□□□ -0.89
DDI1YER143W DPB3P27344 201 aa9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data9.47□□□□□ -0.89not detected
DDI1YER143W DRE2P36152 348 aa9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SMF1P38925 575 aa9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SBE2P42223 864 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W LAM5P43560 674 aa9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W KAP114P53067 1004 aa9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W ALG11P53954 548 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W VPS60Q03390 229 aa9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YMR018WQ04364 514 aa9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YDR222WQ04925 415 aa9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W YDR278CQ05612 105 aa9.47□□□□□ -0.89
DDI1YER143W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W REI1P38344 393 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W RCK2P38623 610 aa9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YHL026CP38740 315 aa9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W GCV2P49095 1034 aa9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W DRN1P53255 507 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W MAL13P53338 473 aa9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 130.9 ms