RNA–Protein interactions for RNA: YER130C

COM2, Transcript of Transcription factor that binds IME1 Upstream Activation Signal (UAS)ru, yeast

Gene COM2, Length 1,332 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COM2	YER130C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	YIR042C	P40586	236 aa		5	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	MUP1	P50276	574 aa		5	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	YNL193W	P53870	558 aa		5	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	ORC4	P54791	529 aa		5	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	ATG11	Q12527	1178 aa		5	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	YLR149C	Q99296	730 aa		5	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	OAR1	P35731	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	YPT53	P36019	220 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	ASM4	Q05166	528 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	FRE5	Q08908	694 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	SFL1	P20134	766 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	MIH1	P23748	554 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	YKR018C	P36114	725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	UBA2	P52488	636 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	ADY4	Q05955	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	ATG33	Q06485	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	TRM13	Q12383	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	YKR051W	P36142	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	MOH1	P38191	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	YBR053C	P38235	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	GAD1	Q04792	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	TGL5	Q12043	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	AIM44	Q99299	758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	APT2	P36973	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	PCL10	P53124	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	OMS1	Q06668	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COM2	YER130C	HMG1	P12683	1054 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	DAS1	P47005	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	AIM14	P53109	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	MCM21	Q06675	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	ACF2	Q12168	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	MGS1	P40151	587 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	YJL163C	P46996	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	MET13	P53128	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	DNM1	P54861	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	TIM44	Q01852	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	GUD1	Q07729	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	BAP3	P41815	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	DOS2	P54858	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	REC102	Q02721	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	PPS1	P38148	807 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	YHR112C	P38716	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	YHL017W	P38745	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	GID8	P40208	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	HOS4	P40480	1083 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	ADR1	P07248	1323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	HLJ1	P48353	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	RIA1	P53893	1110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	YML122C	Q03207	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	MCH5	Q08777	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	MNN4	P36044	1178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	BCD1	P38772	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	FMP52	P40008	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	UBC11	P52492	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	ARP4	P80428	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	IRC13	Q08630	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COM2	YER130C	SSN2	P38931	1420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	APN2	P38207	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	REV7	P38927	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	STB4	P50104	949 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	YAP1802	P53309	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	SGO1	Q08490	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	MAL31	P38156	614 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	CKB2	P38930	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	YJR142W	P47173	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	PMT3	P47190	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	THI73	Q07904	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	BRN1	P38170	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COM2	YER130C	NUP60	P39705	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.5 ms