RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	ECM1	P39715	212 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	HOS4	P40480	1083 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YIR042C	P40586	236 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	BAP3	P41815	604 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YJL163C	P46996	555 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YJR008W	P47085	338 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	UBA2	P52488	636 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	ATG11	Q12527	1178 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	MRC1	P25588	1096 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	SFP1	P32432	683 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	MTH1	P35198	433 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YPT53	P36019	220 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	SAP190	P36123	1033 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YBR259W	P38338	688 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YHL017W	P38745	532 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	ATG36	P46983	293 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YMR206W	Q03695	313 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	IRC10	Q08118	586 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	NTG2	Q08214	380 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.81	□□□□□ -1.8	not detected
AIM4	YBR194W	MIH1	P23748	554 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	PAF1	P38351	445 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	SDS3	P40505	327 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	CAF16	P43569	289 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	DAS1	P47005	663 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	GND2	P53319	492 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	IRC13	Q08630	104 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YLR149C	Q99296	730 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	CDC9	P04819	755 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YEN1	P40028	759 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	SHR5	P41912	237 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	ALY2	P47029	1046 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	BNA2	P47125	453 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	DNM1	P54861	757 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	TIM44	Q01852	431 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	SIR3	P06701	978 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	MEF1	P25039	761 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	BCD1	P38772	366 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	STU2	P46675	888 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	UBC11	P52492	156 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AIM4	YBR194W	ADR1	P07248	1323 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	PEX6	P33760	1030 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	FMP52	P40008	231 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	GID8	P40208	455 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	TPM2	P40414	161 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	PMT3	P47190	753 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	RIA1	P53893	1110 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	SGO1	Q08490	590 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	SUT2	Q12286	268 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	GSY1	P23337	708 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	HIR1	P32479	840 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	YHR112C	P38716	378 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	LYS9	P38999	446 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	TFB2	Q02939	513 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	CRR1	Q05790	422 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	GRX7	P38068	203 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	PCL5	P38794	229 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	HLJ1	P48353	224 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	TEL2	P53038	688 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	VBA3	P25594	458 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	HOG1	P32485	435 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	UBS1	P38290	277 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	MTL1	P53214	551 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	YNL193W	P53870	558 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	GAD1	Q04792	585 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	MCM21	Q06675	368 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	YOL057W	Q08225	711 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	NUP145	P49687	1317 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	SRD1	P09007	221 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	YEL1	P34225	687 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	YKR018C	P36114	725 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	YKR051W	P36142	418 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	YGR237C	P50089	785 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	YBP2	P53169	641 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
AIM4	YBR194W	NHX1	Q04121	633 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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