RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.88□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.88□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 FOXO3O43524 673 aa6.87□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 WISP1O95388 367 aa6.87□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.87□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 PPME1Q9Y570 386 aa6.87□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 FAM196BA6NMK8 535 aa6.86□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 WEE1P30291 646 aa6.86□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 TXKP42681 527 aa6.86□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 CDCA8Q53HL2 280 aa6.86□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.86□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.86□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 EGFRP00533 1210 aa6.85□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 ATP11AP98196 1134 aa6.85□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 Q6ZS46 218 aa6.85□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.85□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 MYO19Q96H55 970 aa6.85□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.85□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.85□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 GSC2O15499 205 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 COX20Q5RI15 118 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 CEP135Q66GS9 1140 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 SLC51AQ86UW1 340 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 ARXQ96QS3 562 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 RNF114Q9Y508 228 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-210ENST00000487548 HMX2A2RU54 273 aa6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 ADAMTS4O75173 837 aa6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 SOX18P35713 384 aa6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 NFIAQ12857 509 aa6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 NLRP13Q86W25 1043 aa6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 SPACA7Q96KW9 195 aa6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 CEP41Q9BYV8 373 aa6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 MUC3BQ9H195 1237 aa6.82□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 A6NJR5 290 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 PRMT3O60678 531 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 RFX1P22670 979 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 CDC27P30260 824 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 SCNN1AP37088 669 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 GRIK1P39086 918 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.81□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 HYAL2Q12891 473 aa6.8□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.8□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.8□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.8□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 FSCN2O14926 492 aa6.79□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 FAM26DQ5JW98 314 aa6.79□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.79□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.79□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.79□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 EPHA1P21709 976 aa6.78□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 RNF43Q68DV7 783 aa6.78□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 OR13H1Q8NG92 308 aa6.78□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.78□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.78□□□□□ -1.32
SENP6-210ENST00000487548 FAM177BA6PVY3 158 aa6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 BMP3P12645 472 aa6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 SPINK2P20155 84 aa6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 C16orf46Q6P387 395 aa6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 GPR152Q8TDT2 470 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms