RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Map10Q8BJS7 891 aa17.77■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igflr1Q3U4N7 345 aa17.77■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccne2Q9Z238 404 aa17.77■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc38a10Q5I012 1090 aa17.76■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Shisa4Q8CA71 197 aa17.76■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa17.76■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ube2hP62257 183 aa17.76■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa17.76■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Syce3B5KM66 88 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kdm4aQ8BW72 1064 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tsr2Q8C8T8 191 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atad2Q8CDM1 1040 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Irgm2A0A140LIF8 407 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stat1P42225 749 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ift57Q8BXG3 429 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 E4f1Q8CCE9 783 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep57l1Q8VDS7 400 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam84aQ9D650 292 aa17.75■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sik3Q6P4S6 1311 aa17.74■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam160b2Q80YR2 744 aa17.74■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SlkO54988 1233 aa17.74■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ube3bQ9ES34 1070 aa17.74■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc178Q8CDV0 866 aa17.74■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igbp1bQ9QZ29 343 aa17.74■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Qtrt2B8ZXI1 415 aa17.73■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sept1P42209 366 aa17.73■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp2b3Q0VF55 1220 aa17.73■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Me3Q8BMF3 604 aa17.73■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lmbrd2Q8C561 694 aa17.73■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa17.73■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plbd2Q3TCN2 594 aa17.73■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp2d34L7N463 504 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myh3P13541 1940 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd22P35329 862 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Itga6Q61739 1091 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21985Q6P6P5 1106 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zscan22Q8BGS5 496 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AidaQ8C4Q6 305 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Med4Q9CQA5 270 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pde8bE9Q4S1 865 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nol12Q8BG17 217 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Appbp2Q9DAX9 585 aa17.72■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bin2D3Z6Q9 489 aa17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SowahdQ8BY98 327 aa17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plcd4Q8K3R3 807 aa17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BrapQ99MP8 591 aa17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp48Q3V0C5 1052 aa17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Esco1Q69Z69 843 aa17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Edrf1Q6GQV7 1239 aa17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ncaph2Q8BSP2 607 aa17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Setdb1O88974 1307 aa17.71■□□□□ 0.43
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TrdnE9Q9K5 693 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prl3d1P18121 224 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 IncenpQ9WU62 880 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Phrf1A6H619 1682 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AU015836B2RUM3 263 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rtkn2Q14B46 604 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Susd4Q8BH32 490 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim59Q922Y2 403 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr19Q3UGF1 1341 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hap1O35668 628 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pald1P70261 859 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sptlc3Q8BG54 563 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Alx1Q8C8B0 326 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Riok1Q922Q2 567 aa17.7■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim34bJ3QNR8 485 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nme8Q715T0 586 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr24Q8CFJ9 790 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BcanQ61361 883 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp7a1Q64505 503 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nlrp9aQ66X03 949 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc66Q6NS45 935 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abtb2Q7TQI7 1024 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ErmnQ5EBJ4 281 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slfnl1Q8BHW9 410 aa17.69■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyb5rlB1AS42 316 aa17.68■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 EappQ5BU09 281 aa17.68■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ZwintQ9CQU5 252 aa17.68■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dpf1Q9QX66 387 aa17.68■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sall1Q9ER74 1322 aa17.67■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp2d9P11714 504 aa17.67■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttc14Q9CSP9 761 aa17.67■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ltbp1Q8CG19 1712 aa17.67■□□□□ 0.42
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vsig10D3YX43 558 aa17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.4 ms