RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp13P10754 512 aa14.74□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irf1P15314 329 aa14.74□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oprd1P32300 372 aa14.74□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lyrm4Q8K215 91 aa14.74□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fitm1Q91V79 292 aa14.74□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SpdefQ9WTP3 325 aa14.74□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tacr1P30548 407 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LhcgrP30730 700 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thbs1P35441 1170 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taf13P61216 124 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1225Q7TR01 311 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adam30Q811Q3 732 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec22aQ8BH47 307 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gemin8Q8BHE1 238 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr539Q8VGL9 319 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dapp1Q9QXT1 280 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pla2g2fQ9QZT4 168 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 6430628N08RikA0A0U1RQ45 177 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem74bA2AU34 232 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc16a5G5E8K6 468 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcpt9O35164 246 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01635 115 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GdnfP48540 211 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930512M02RikQ5SQK8 218 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hapln3Q80WM5 359 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cacul1Q8R0X2 377 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr780Q8VEU0 312 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrgpra3Q91WW3 302 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cops7aQ9CZ04 275 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Isg20Q9JL16 300 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcne3Q9WTW2 103 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Padi1Q9Z185 662 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rgs21V9GXQ3 152 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map1bP14873 2464 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem182B2RVY9 229 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930467E23RikD3Z1P8 350 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srp54bE9PXC0 504 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm15319E9Q637 350 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mapk14P47811 360 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igfbp1P47876 272 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Them4Q3UUI3 230 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IfnkQ7TSL0 199 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prss34Q80UR4 318 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc30a8Q8BGG0 367 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sdhaf3Q8BQU3 125 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21119Q8C646 350 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cacnb4Q8R0S4 519 aa14.73□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ighv1-13A0A075B5I0 98 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm45062E0CZ38 131 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btbd2E9PUS2 523 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IghgP01863 330 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AdaP03958 352 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc6a1P31648 599 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mmp2P33434 662 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc38a8Q5HZH7 432 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc39Q8BGI7 337 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf436Q8BPP0 452 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Timmdc1Q8BUY5 285 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csnk1g2Q8BVP5 415 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Amdhd2Q8JZV7 409 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thap7Q8VCZ3 309 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sav1Q8VEB2 386 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Jam3Q9D8B7 310 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Derl3Q9D8K3 228 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cldn12Q9ET43 244 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7697A0A0J9YUH2 350 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm9495A0A0J9YUZ3 350 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm45736A0A1B0GS18 427 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1156A2AVC3 323 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmed7D3YZZ5 224 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4933403O08RikF6UK53 379 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bcl2l11O54918 196 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fcer1aP20489 250 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttyh2Q3TH73 532 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8332Q3UTA4 144 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RgmaQ6PCX7 454 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pamr1Q8BU25 720 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr99Q8VFE4 305 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Emc3Q99KI3 261 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccnl2Q9JJA7 518 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col4a6B1AVK5 1691 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igkv12-38A0A0G2JEI7 115 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec61a1P61620 476 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk5r1P61809 307 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rps15P62843 145 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim63Q38HM4 350 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Shisa3Q3UPR0 238 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ube2j2Q6P073 259 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr517Q7TRU4 314 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr270Q7TS19 314 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pi15Q8BS03 258 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrn3Q8CBC6 707 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrtm1Q8K377 522 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pttg1ipQ8R143 174 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35a4Q9D321 324 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Izumo1Q9D9J7 397 aa14.72□□□□□ -0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Raet1dQ9JI58 249 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.3 ms