Protein–RNA interactions for Protein: O54918

Bcl2l11, Bcl-2-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl2l11O54918 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl2l11O54918 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl2l11O54918 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl2l11O54918 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl2l11O54918 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Bcl2l11O54918 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Bcl2l11O54918 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Bcl2l11O54918 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl2l11O54918 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl2l11O54918 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Bcl2l11O54918 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl2l11O54918 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl2l11O54918 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcl2l11O54918 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl2l11O54918 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl2l11O54918 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl2l11O54918 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bcl2l11O54918 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl2l11O54918 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcl2l11O54918 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcl2l11O54918 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcl2l11O54918 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl2l11O54918 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl2l11O54918 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl2l11O54918 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl2l11O54918 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl2l11O54918 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcl2l11O54918 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bcl2l11O54918 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl2l11O54918 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl2l11O54918 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl2l11O54918 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl2l11O54918 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl2l11O54918 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl2l11O54918 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl2l11O54918 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl2l11O54918 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl2l11O54918 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl2l11O54918 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl2l11O54918 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl2l11O54918 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl2l11O54918 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl2l11O54918 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bcl2l11O54918 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcl2l11O54918 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Bcl2l11O54918 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcl2l11O54918 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bcl2l11O54918 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bcl2l11O54918 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcl2l11O54918 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcl2l11O54918 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl2l11O54918 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl2l11O54918 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl2l11O54918 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl2l11O54918 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl2l11O54918 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bcl2l11O54918 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl2l11O54918 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcl2l11O54918 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcl2l11O54918 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bcl2l11O54918 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcl2l11O54918 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bcl2l11O54918 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bcl2l11O54918 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bcl2l11O54918 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Bcl2l11O54918 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcl2l11O54918 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcl2l11O54918 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bcl2l11O54918 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bcl2l11O54918 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl2l11O54918 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl2l11O54918 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl2l11O54918 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcl2l11O54918 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl2l11O54918 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl2l11O54918 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl2l11O54918 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl2l11O54918 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcl2l11O54918 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcl2l11O54918 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl2l11O54918 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bcl2l11O54918 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl2l11O54918 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl2l11O54918 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl2l11O54918 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl2l11O54918 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Bcl2l11O54918 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl2l11O54918 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl2l11O54918 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcl2l11O54918 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcl2l11O54918 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl2l11O54918 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl2l11O54918 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl2l11O54918 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl2l11O54918 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl2l11O54918 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl2l11O54918 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl2l11O54918 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl2l11O54918 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl2l11O54918 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms