Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI58

Raet1d, Retinoic acid early-inducible protein 1-delta, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1dQ9JI58 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Raet1dQ9JI58 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Raet1dQ9JI58 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Raet1dQ9JI58 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Raet1dQ9JI58 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Raet1dQ9JI58 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Raet1dQ9JI58 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Raet1dQ9JI58 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Raet1dQ9JI58 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Raet1dQ9JI58 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Raet1dQ9JI58 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Raet1dQ9JI58 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Raet1dQ9JI58 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Raet1dQ9JI58 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Raet1dQ9JI58 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Raet1dQ9JI58 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Raet1dQ9JI58 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Raet1dQ9JI58 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Raet1dQ9JI58 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Raet1dQ9JI58 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Raet1dQ9JI58 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Raet1dQ9JI58 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Raet1dQ9JI58 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Raet1dQ9JI58 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Raet1dQ9JI58 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Raet1dQ9JI58 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Raet1dQ9JI58 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Raet1dQ9JI58 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Raet1dQ9JI58 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Raet1dQ9JI58 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Raet1dQ9JI58 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Raet1dQ9JI58 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Raet1dQ9JI58 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Raet1dQ9JI58 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Raet1dQ9JI58 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Raet1dQ9JI58 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Raet1dQ9JI58 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Raet1dQ9JI58 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Raet1dQ9JI58 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Raet1dQ9JI58 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Raet1dQ9JI58 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Raet1dQ9JI58 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Raet1dQ9JI58 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Raet1dQ9JI58 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Raet1dQ9JI58 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,92
Raet1dQ9JI58 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Raet1dQ9JI58 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Raet1dQ9JI58 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Raet1dQ9JI58 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Raet1dQ9JI58 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Raet1dQ9JI58 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Raet1dQ9JI58 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Raet1dQ9JI58 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Raet1dQ9JI58 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Raet1dQ9JI58 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Raet1dQ9JI58 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Raet1dQ9JI58 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Raet1dQ9JI58 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Raet1dQ9JI58 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Raet1dQ9JI58 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Raet1dQ9JI58 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Raet1dQ9JI58 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Raet1dQ9JI58 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Raet1dQ9JI58 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Raet1dQ9JI58 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Raet1dQ9JI58 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Raet1dQ9JI58 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Raet1dQ9JI58 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Raet1dQ9JI58 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Raet1dQ9JI58 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Raet1dQ9JI58 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
Raet1dQ9JI58 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Raet1dQ9JI58 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Raet1dQ9JI58 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Raet1dQ9JI58 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Raet1dQ9JI58 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Raet1dQ9JI58 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Raet1dQ9JI58 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,77
Raet1dQ9JI58 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Raet1dQ9JI58 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Raet1dQ9JI58 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Raet1dQ9JI58 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Raet1dQ9JI58 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Raet1dQ9JI58 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Raet1dQ9JI58 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Raet1dQ9JI58 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Raet1dQ9JI58 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Raet1dQ9JI58 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Raet1dQ9JI58 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Raet1dQ9JI58 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Raet1dQ9JI58 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Raet1dQ9JI58 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Raet1dQ9JI58 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Raet1dQ9JI58 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Raet1dQ9JI58 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Raet1dQ9JI58 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Raet1dQ9JI58 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Raet1dQ9JI58 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Raet1dQ9JI58 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Raet1dQ9JI58 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
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