Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Padi1Q9Z185 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Padi1Q9Z185 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Padi1Q9Z185 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Padi1Q9Z185 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Padi1Q9Z185 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Padi1Q9Z185 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Padi1Q9Z185 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Padi1Q9Z185 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Padi1Q9Z185 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Padi1Q9Z185 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Padi1Q9Z185 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Padi1Q9Z185 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Padi1Q9Z185 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Padi1Q9Z185 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Padi1Q9Z185 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Padi1Q9Z185 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Padi1Q9Z185 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Padi1Q9Z185 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Padi1Q9Z185 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Padi1Q9Z185 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Padi1Q9Z185 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Padi1Q9Z185 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Padi1Q9Z185 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Padi1Q9Z185 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Padi1Q9Z185 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Padi1Q9Z185 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Padi1Q9Z185 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Padi1Q9Z185 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Padi1Q9Z185 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Padi1Q9Z185 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Padi1Q9Z185 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Padi1Q9Z185 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Padi1Q9Z185 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Padi1Q9Z185 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Padi1Q9Z185 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Padi1Q9Z185 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Padi1Q9Z185 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Padi1Q9Z185 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Padi1Q9Z185 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Padi1Q9Z185 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Padi1Q9Z185 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Padi1Q9Z185 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Padi1Q9Z185 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Padi1Q9Z185 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Padi1Q9Z185 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Padi1Q9Z185 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Padi1Q9Z185 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Padi1Q9Z185 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Padi1Q9Z185 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Padi1Q9Z185 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Padi1Q9Z185 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Padi1Q9Z185 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Padi1Q9Z185 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Padi1Q9Z185 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Padi1Q9Z185 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Padi1Q9Z185 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Padi1Q9Z185 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Padi1Q9Z185 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Padi1Q9Z185 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Padi1Q9Z185 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Padi1Q9Z185 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Padi1Q9Z185 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Padi1Q9Z185 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Padi1Q9Z185 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Padi1Q9Z185 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Padi1Q9Z185 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Padi1Q9Z185 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Padi1Q9Z185 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Padi1Q9Z185 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Padi1Q9Z185 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Padi1Q9Z185 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Padi1Q9Z185 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Padi1Q9Z185 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Padi1Q9Z185 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Padi1Q9Z185 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Padi1Q9Z185 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Padi1Q9Z185 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Padi1Q9Z185 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Padi1Q9Z185 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Padi1Q9Z185 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Padi1Q9Z185 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Padi1Q9Z185 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Padi1Q9Z185 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Padi1Q9Z185 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Padi1Q9Z185 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Padi1Q9Z185 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Padi1Q9Z185 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Padi1Q9Z185 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Padi1Q9Z185 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Padi1Q9Z185 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Padi1Q9Z185 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Padi1Q9Z185 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Padi1Q9Z185 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Padi1Q9Z185 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Padi1Q9Z185 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Padi1Q9Z185 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Padi1Q9Z185 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Padi1Q9Z185 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Padi1Q9Z185 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms