Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim63Q38HM4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim63Q38HM4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim63Q38HM4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim63Q38HM4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim63Q38HM4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim63Q38HM4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim63Q38HM4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim63Q38HM4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim63Q38HM4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim63Q38HM4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim63Q38HM4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim63Q38HM4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim63Q38HM4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim63Q38HM4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim63Q38HM4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim63Q38HM4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim63Q38HM4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim63Q38HM4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim63Q38HM4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim63Q38HM4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim63Q38HM4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim63Q38HM4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim63Q38HM4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim63Q38HM4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim63Q38HM4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim63Q38HM4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim63Q38HM4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim63Q38HM4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim63Q38HM4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim63Q38HM4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim63Q38HM4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim63Q38HM4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim63Q38HM4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim63Q38HM4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim63Q38HM4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim63Q38HM4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim63Q38HM4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim63Q38HM4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim63Q38HM4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim63Q38HM4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim63Q38HM4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim63Q38HM4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim63Q38HM4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim63Q38HM4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim63Q38HM4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim63Q38HM4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim63Q38HM4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim63Q38HM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim63Q38HM4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim63Q38HM4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim63Q38HM4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim63Q38HM4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim63Q38HM4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim63Q38HM4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim63Q38HM4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim63Q38HM4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim63Q38HM4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim63Q38HM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim63Q38HM4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim63Q38HM4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim63Q38HM4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim63Q38HM4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim63Q38HM4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim63Q38HM4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim63Q38HM4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim63Q38HM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim63Q38HM4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim63Q38HM4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim63Q38HM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim63Q38HM4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim63Q38HM4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim63Q38HM4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim63Q38HM4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim63Q38HM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim63Q38HM4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim63Q38HM4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim63Q38HM4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim63Q38HM4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim63Q38HM4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim63Q38HM4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim63Q38HM4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim63Q38HM4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim63Q38HM4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim63Q38HM4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim63Q38HM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim63Q38HM4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim63Q38HM4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim63Q38HM4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim63Q38HM4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim63Q38HM4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim63Q38HM4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim63Q38HM4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim63Q38HM4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim63Q38HM4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim63Q38HM4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim63Q38HM4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim63Q38HM4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim63Q38HM4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim63Q38HM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms