Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Thbs1P35441 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Thbs1P35441 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Thbs1P35441 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Thbs1P35441 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Thbs1P35441 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Thbs1P35441 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Thbs1P35441 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Thbs1P35441 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Thbs1P35441 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Thbs1P35441 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Thbs1P35441 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Thbs1P35441 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,95■■■□□ 2,23
Thbs1P35441 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Thbs1P35441 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Thbs1P35441 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Thbs1P35441 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Thbs1P35441 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Thbs1P35441 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Thbs1P35441 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Thbs1P35441 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Thbs1P35441 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Thbs1P35441 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Thbs1P35441 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Thbs1P35441 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Thbs1P35441 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Thbs1P35441 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Thbs1P35441 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Thbs1P35441 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Thbs1P35441 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Thbs1P35441 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Thbs1P35441 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Thbs1P35441 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Thbs1P35441 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Thbs1P35441 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Thbs1P35441 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Thbs1P35441 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Thbs1P35441 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Thbs1P35441 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Thbs1P35441 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Thbs1P35441 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Thbs1P35441 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Thbs1P35441 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Thbs1P35441 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Thbs1P35441 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Thbs1P35441 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Thbs1P35441 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Thbs1P35441 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Thbs1P35441 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Thbs1P35441 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Thbs1P35441 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Thbs1P35441 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Thbs1P35441 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Thbs1P35441 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Thbs1P35441 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Thbs1P35441 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Thbs1P35441 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Thbs1P35441 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Thbs1P35441 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Thbs1P35441 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Thbs1P35441 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
Thbs1P35441 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Thbs1P35441 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Thbs1P35441 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Thbs1P35441 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Thbs1P35441 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Thbs1P35441 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Thbs1P35441 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Thbs1P35441 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Thbs1P35441 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Thbs1P35441 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Thbs1P35441 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Thbs1P35441 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Thbs1P35441 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Thbs1P35441 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Thbs1P35441 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Thbs1P35441 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Thbs1P35441 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Thbs1P35441 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Thbs1P35441 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Thbs1P35441 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Thbs1P35441 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Thbs1P35441 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Thbs1P35441 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Thbs1P35441 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1,75
Thbs1P35441 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Thbs1P35441 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Thbs1P35441 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Thbs1P35441 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Thbs1P35441 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Thbs1P35441 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Thbs1P35441 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Thbs1P35441 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Thbs1P35441 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Thbs1P35441 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Thbs1P35441 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Thbs1P35441 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Thbs1P35441 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Thbs1P35441 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Thbs1P35441 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms