Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Derl3Q9D8K3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Derl3Q9D8K3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Derl3Q9D8K3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Derl3Q9D8K3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Derl3Q9D8K3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Derl3Q9D8K3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Derl3Q9D8K3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Derl3Q9D8K3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Derl3Q9D8K3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Derl3Q9D8K3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Derl3Q9D8K3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Derl3Q9D8K3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Derl3Q9D8K3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Derl3Q9D8K3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Derl3Q9D8K3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Derl3Q9D8K3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Derl3Q9D8K3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Derl3Q9D8K3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Derl3Q9D8K3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Derl3Q9D8K3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Derl3Q9D8K3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Derl3Q9D8K3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Derl3Q9D8K3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Derl3Q9D8K3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Derl3Q9D8K3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Derl3Q9D8K3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Derl3Q9D8K3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Derl3Q9D8K3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Derl3Q9D8K3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Derl3Q9D8K3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Derl3Q9D8K3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Derl3Q9D8K3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Derl3Q9D8K3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Derl3Q9D8K3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Derl3Q9D8K3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Derl3Q9D8K3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Derl3Q9D8K3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Derl3Q9D8K3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Derl3Q9D8K3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Derl3Q9D8K3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Derl3Q9D8K3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Derl3Q9D8K3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Derl3Q9D8K3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Derl3Q9D8K3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Derl3Q9D8K3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Derl3Q9D8K3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Derl3Q9D8K3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Derl3Q9D8K3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Derl3Q9D8K3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Derl3Q9D8K3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Derl3Q9D8K3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Derl3Q9D8K3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Derl3Q9D8K3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Derl3Q9D8K3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Derl3Q9D8K3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Derl3Q9D8K3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Derl3Q9D8K3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Derl3Q9D8K3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Derl3Q9D8K3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Derl3Q9D8K3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Derl3Q9D8K3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Derl3Q9D8K3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Derl3Q9D8K3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,45■■□□□ 1,51
Derl3Q9D8K3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Derl3Q9D8K3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Derl3Q9D8K3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Derl3Q9D8K3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Derl3Q9D8K3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Derl3Q9D8K3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Derl3Q9D8K3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
Derl3Q9D8K3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Derl3Q9D8K3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Derl3Q9D8K3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Derl3Q9D8K3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Derl3Q9D8K3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,09■■□□□ 1,45
Derl3Q9D8K3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Derl3Q9D8K3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Derl3Q9D8K3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Derl3Q9D8K3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Derl3Q9D8K3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Derl3Q9D8K3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Derl3Q9D8K3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Derl3Q9D8K3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Derl3Q9D8K3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Derl3Q9D8K3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Derl3Q9D8K3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Derl3Q9D8K3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Derl3Q9D8K3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Derl3Q9D8K3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Derl3Q9D8K3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Derl3Q9D8K3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Derl3Q9D8K3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Derl3Q9D8K3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
Derl3Q9D8K3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Derl3Q9D8K3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Derl3Q9D8K3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Derl3Q9D8K3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Derl3Q9D8K3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms