Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Derl3Q9D8K3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Derl3Q9D8K3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Derl3Q9D8K3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Derl3Q9D8K3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Derl3Q9D8K3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Derl3Q9D8K3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Derl3Q9D8K3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Derl3Q9D8K3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Derl3Q9D8K3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Derl3Q9D8K3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Derl3Q9D8K3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Derl3Q9D8K3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Derl3Q9D8K3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Derl3Q9D8K3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Derl3Q9D8K3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Derl3Q9D8K3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Derl3Q9D8K3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Derl3Q9D8K3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Derl3Q9D8K3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Derl3Q9D8K3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Derl3Q9D8K3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Derl3Q9D8K3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Derl3Q9D8K3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Derl3Q9D8K3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Derl3Q9D8K3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Derl3Q9D8K3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Derl3Q9D8K3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Derl3Q9D8K3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Derl3Q9D8K3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Derl3Q9D8K3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Derl3Q9D8K3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Derl3Q9D8K3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Derl3Q9D8K3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Derl3Q9D8K3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Derl3Q9D8K3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Derl3Q9D8K3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Derl3Q9D8K3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Derl3Q9D8K3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Derl3Q9D8K3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Derl3Q9D8K3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Derl3Q9D8K3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Derl3Q9D8K3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Derl3Q9D8K3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Derl3Q9D8K3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Derl3Q9D8K3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Derl3Q9D8K3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Derl3Q9D8K3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Derl3Q9D8K3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Derl3Q9D8K3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Derl3Q9D8K3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Derl3Q9D8K3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Derl3Q9D8K3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Derl3Q9D8K3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Derl3Q9D8K3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Derl3Q9D8K3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Derl3Q9D8K3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Derl3Q9D8K3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Derl3Q9D8K3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Derl3Q9D8K3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Derl3Q9D8K3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Derl3Q9D8K3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Derl3Q9D8K3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Derl3Q9D8K3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Derl3Q9D8K3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Derl3Q9D8K3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Derl3Q9D8K3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Derl3Q9D8K3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Derl3Q9D8K3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Derl3Q9D8K3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Derl3Q9D8K3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Derl3Q9D8K3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Derl3Q9D8K3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Derl3Q9D8K3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Derl3Q9D8K3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Derl3Q9D8K3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Derl3Q9D8K3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Derl3Q9D8K3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Derl3Q9D8K3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Derl3Q9D8K3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Derl3Q9D8K3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Derl3Q9D8K3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Derl3Q9D8K3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Derl3Q9D8K3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Derl3Q9D8K3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Derl3Q9D8K3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Derl3Q9D8K3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Derl3Q9D8K3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Derl3Q9D8K3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Derl3Q9D8K3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Derl3Q9D8K3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Derl3Q9D8K3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Derl3Q9D8K3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Derl3Q9D8K3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Derl3Q9D8K3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Derl3Q9D8K3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Derl3Q9D8K3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Derl3Q9D8K3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Derl3Q9D8K3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms