RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	MIB2	Q96AX9	1013 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HAVCR1	Q96D42	359 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MAP6	Q96JE9	813 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		16.76	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MPDZ	O75970	2070 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR2W5	A6NFC9	320 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PRR32	B1ATL7	298 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ACOT7	O00154	380 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SLC6A8	P48029	635 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	P2RX3	P56373	397 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ESCO2	Q56NI9	601 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR6V1	Q8N148	313 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	THRSP	Q92748	146 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LPAR4	Q99677	370 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	DLL4	Q9NR61	685 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GUH1	482 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPC4	97 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PHYH	O14832	338 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A5	O76082	557 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	REN	P00797	406 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	DNASE1	P24855	282 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PTH2R	P49190	550 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	EGR3	Q06889	387 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ELOC	Q15369	112 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	BEST4	Q8NFU0	473 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ORAI1	Q96D31	301 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL15	Q96M94	604 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GPR174	Q9BXC1	333 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		16.75	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LILRA5	A6NI73	299 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	UTS2	O95399	124 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LCN1	P31025	176 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	RORA	P35398	523 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GABRA4	P48169	554 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	EPHA4	P54764	986 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SLC37A1	P57057	533 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	BMPER	Q8N8U9	685 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	NXPE2	Q96DL1	559 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MED30	Q96HR3	178 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TSSK2	Q96PF2	358 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	WDR76	Q9H967	626 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP7	Q9Y680	259 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		16.74	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM212	A6NML5	194 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GMDS	O60547	372 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SNAPC5	O75971	98 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD16A	O95870	558 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CD1C	P29017	333 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FNTB	P49356	437 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	EGR4	Q05215	589 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CAMK2B	Q13554	666 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GRM7	Q14831	915 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CBLN3	Q6UW01	205 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF563	Q8TA94	476 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LMF1	Q96S06	567 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SLC38A3	Q99624	504 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LAT2	Q9GZY6	243 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FKRP	Q9H9S5	495 aa		16.73	■□□□□ 0.27

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