RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A PER1P25625 357 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YHR033WP38690 423 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A PIH1P38768 344 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MNN1P39106 762 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YGR053CP53234 283 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A RGT2Q12300 763 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A ACE2P21192 770 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MET12P46151 657 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A STB2P46679 850 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A AMA1P50082 593 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SRT1Q03175 343 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A GAL11P19659 1081 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A APL3P38065 1025 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A ENT3P47160 408 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MPS1P54199 764 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A CTR9P89105 1077 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SEG1Q04279 960 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A DUS4Q06063 367 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A NDJ1Q12366 352 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A TRM11Q12463 433 aa0.98□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A VBA3P25594 458 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A EUG1P32474 517 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A VBA5P36172 582 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MTG2P38860 518 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A GNP1P48813 663 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A PRP31P49704 494 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MDR1P53258 950 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A ATP23P53722 227 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MSC2Q03455 724 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A STP4Q07351 490 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A IRC13Q08630 104 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SNF5P18480 905 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A VPS34P22543 875 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A URA1P28272 314 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A REC104P33323 182 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A PPX1P38698 397 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MET10P39692 1035 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SAP155P43612 1002 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YGR125WP53273 1036 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YBR056W-AI2HB52 66 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A PHO4P07270 312 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A NTH1P32356 751 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A FLO5P38894 1075 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A ORC1P54784 914 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A TRS23Q03784 219 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A HRQ1Q05549 1077 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A ZRT2Q12436 422 aa0.97□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A BNR1P40450 1375 aa0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A HEM3P28789 327 aa0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A DCG1P32460 244 aa0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YBR238CP38330 731 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A CHS7P38843 316 aa0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A QRI1P43123 477 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A DUS1P53759 423 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A GPD1Q00055 391 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A NAN1Q02931 896 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A UBX5Q06682 500 aa0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A GUP2Q08929 609 aa0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A RER2P35196 286 aa0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SDS3P40505 327 aa0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A PSA1P41940 361 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A USV1Q12132 391 aa0.96□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SEC12P11655 471 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SFP1P32432 683 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ECM21P38167 1117 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SAT4P25333 603 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SIP5P40210 489 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A VPS73P53142 486 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ERP6P53198 216 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YNL144CP53907 740 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YKR011CQ02209 353 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A NGL2Q03264 515 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A GFD1Q04839 188 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A COQ11Q05892 277 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YDL086WQ07505 273 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A CYC8P14922 966 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A HSP60P19882 572 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SBA1P28707 216 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A AFG2P32794 780 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A PBY1P38254 753 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A DUN1P39009 513 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A FYV10P40492 516 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A AIM44Q99299 758 aa0.95□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A STE13P33894 931 aa0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A FAA4P47912 694 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SQS1P53866 767 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ALD6P54115 500 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A RPN7Q06103 429 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A MRI1Q06489 411 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SRP40P32583 406 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YAT2P40017 923 aa0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data0.94□□□□□ -2.26not detected
YPL060C-AYPL060C-A ADY3Q07732 790 aa0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ERG20P08524 352 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A RDH54P38086 958 aa0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ARP4P80428 489 aa0.94□□□□□ -2.26
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