RNA–Protein interactions for RNA: YNR067C

DSE4, Transcript of Daughter cell-specific secreted protein with similarity to glucanases, yeast

Gene DSE4, Length 3,354 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE4	YNR067C	RSC3	Q06639	885 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PMS1	P14242	873 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CAB3	P36076	571 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YRO2	P38079	344 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SPO74	P45819	413 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YNL165W	P53891	406 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	FCP1	Q03254	732 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	NUR1	Q12066	484 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	DCS2	Q12123	353 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MET17	P06106	444 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CMP2	P14747	604 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	APN1	P22936	367 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SWC3	P31376	625 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MLF3	P32047	452 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	HOG1	P32485	435 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	DLD1	P32891	587 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	XRS2	P33301	854 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	AXL2	P38928	823 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	VPS41	P38959	992 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	POL31	P46957	487 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MRPL13	Q02204	264 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	VTC3	Q02725	835 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	COG8	Q04632	607 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	EST2	Q06163	884 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	KCS1	Q12494	1050 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CDC16	P09798	840 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PER1	P25625	357 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	KAP122	P32767	1081 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	NPL6	P32832	435 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RIB7	P33312	244 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SPC72	P39723	622 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RIC1	P40395	1056 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ENT3	P47160	408 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YNR061C	P53747	219 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ADE8	P04161	214 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CKA1	P15790	372 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	APM3	P38153	483 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SHU2	P38957	223 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	KHA1	P40309	873 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YJL068C	P40363	299 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
DSE4	YNR067C	CIT3	P43635	486 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ALF1	P53904	254 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ARP7	Q12406	477 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
DSE4	YNR067C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SMI1	P32566	505 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YBR225W	P38321	900 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SAW1	P39735	261 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YIL092W	P40497	633 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	LYS14	P40971	790 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	GYP8	P43570	497 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SAP155	P43612	1002 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PEX25	Q02969	394 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SFI1	Q12369	946 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SEM1	O94742	89 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	REC107	P21651	314 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	GPI10	P30777	616 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	UME6	P39001	836 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	IMA5	P40884	581 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RMD8	P43620	662 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SAP4	P53036	818 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RIA1	P53893	1110 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	GYL1	Q04322	720 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	VID22	Q05934	901 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	APL4	Q12028	832 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	FRE6	Q12473	712 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	HOP1	P20050	605 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DSE4	YNR067C	NPP1	P25353	742 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DSE4	YNR067C	NGG1	P32494	702 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DSE4	YNR067C	RDH54	P38086	958 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DSE4	YNR067C	ERT1	P38140	529 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DSE4	YNR067C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
DSE4	YNR067C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
DSE4	YNR067C	PSF2	P40359	213 aa		3.09	□□□□□ -1.92

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