RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	MND2	P40577	368 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	ZIP2	P53061	704 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	YGR012W	P53206	393 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	ASM4	Q05166	528 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	CHS2	P14180	963 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	HSL7	P38274	827 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	BEM4	P39011	633 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	NIT3	P49954	291 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	OSW2	Q12202	724 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	CHA4	P43634	648 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MPD2	Q99316	277 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	GAL1	P04385	528 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	SPS1	P08458	490 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	NCS6	P53088	359 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	UPC2	Q12151	913 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	IME1	P21190	360 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	AIM26	P32858	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	GTS1	P40956	396 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	CIA1	Q05583	330 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MSS18	P08593	268 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	SWI6	P09959	803 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	SRP101	P32916	621 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	ICP55	P40051	511 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	CEP3	P40969	608 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	TRE2	Q08693	809 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	HIR1	P32479	840 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	GRX7	P38068	203 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MAL31	P38156	614 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MET12	P46151	657 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	AEP2	P22136	580 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	SCT1	P32784	759 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	BIT2	P38346	545 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	SDP1	P40479	209 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	PIP2	P52960	996 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	ERG5	P54781	538 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	FLR1	P38124	548 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	IES1	P43579	692 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	ALY2	P47029	1046 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	YGR130C	P53278	816 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MET14	Q02196	202 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	HMI1	Q12039	706 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
DSS1	YMR287C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	DID4	P36108	232 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	PCL10	P53124	433 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	MRPS35	P53292	345 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	LAS17	Q12446	633 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	SPE1	P08432	466 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	TAT1	P38085	619 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	GAL10	P04397	699 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	TOS1	P38288	455 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DSS1	YMR287C	HSF1	P10961	833 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	KAE1	P36132	386 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	IRC5	P43610	853 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	VPS62	P53285	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	CYC7	P00045	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	ADP1	P25371	1049 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	APL1	P27351	700 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	YGR153W	P48238	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	INP52	P50942	1183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	YPS7	Q06325	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	RSB1	Q08417	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
DSS1	YMR287C	DIF1	O13577	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	KCC4	P25389	1037 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	YHL041W	P38730	149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	YGR021W	P53212	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DSS1	YMR287C	MTC7	P32633	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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