RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	DBF4	P32325	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	ORC2	P32833	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	KTR2	P33550	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	FIR1	P40020	876 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MGS1	P40151	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YIL166C	P40445	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MON1	P53129	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	BUD9	P53226	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MRPL19	P53875	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SDH5	Q08230	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	APC5	Q08683	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	BNI1	P41832	1953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YRA2	YKL214C	RAD53	P22216	821 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YRA2	YKL214C	RAD16	P31244	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SPC29	P33419	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MCM7	P38132	845 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RRM3	P38766	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RAD55	P38953	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RET2	P43621	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MET13	P53128	600 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
YRA2	YKL214C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	HIM1	Q06674	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	TAH18	Q12181	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RMP1	Q12530	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MDM12	Q92328	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	AI3	P03877	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	DAL7	P21826	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	DAL3	P32459	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SFA1	P32771	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SQT1	P35184	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	PSY4	P38193	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	NIT2	P47016	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YJR096W	P47137	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	KEL2	P50090	882 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YKU80	Q04437	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SCM3	Q12334	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	NUP170	P38181	1502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SAC7	P17121	654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	AAC3	P18238	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	LYP1	P32487	611 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YBR284W	P38150	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	BSD2	P38356	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RSM26	P47141	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YML6	P51998	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	TIM50	Q02776	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	BLS1	Q06071	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SWA2	Q06677	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MLP2	P40457	1679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	FLP1	P03870	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MSS18	P08593	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	TOP3	P13099	656 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SEG2	P34250	1132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	BIT2	P38346	545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YEL068C	P39977	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	PCL10	P53124	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SEC5	P89102	971 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
YRA2	YKL214C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	GUD1	Q07729	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
YRA2	YKL214C	SNT2	P53127	1403 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	CDC9	P04819	755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
YRA2	YKL214C	SFL1	P20134	766 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MSN1	P22148	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	IME2	P32581	645 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SCT1	P32784	759 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MAC1	P35192	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	BYE1	P36106	594 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	ESL2	P36168	1195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	CKB2	P38930	258 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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