RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HCA4	YJL033W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	ATG19	P35193	415 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	THI80	P35202	319 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
HCA4	YJL033W	BUD6	P41697	788 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	MET12	P46151	657 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	PPM2	Q08282	695 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	CDC6	P09119	513 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	BET3	P36149	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	ADY3	Q07732	790 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	HMI1	Q12039	706 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	QCR6	P00127	147 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	ERT1	P38140	529 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	GCV2	P49095	1034 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	VPS62	P53285	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	VPS30	Q02948	557 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	YLR358C	O13565	187 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	SPE1	P08432	466 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	CDC20	P26309	610 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	RTA1	P53047	317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	PDR11	P40550	1411 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
HCA4	YJL033W	EMC1	P25574	760 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HCA4	YJL033W	HIS5	P07172	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	PAF1	P38351	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	NIT3	P49954	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	STE13	P33894	931 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	YAP6	Q03935	383 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	BNR1	P40450	1375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	NUP82	P40368	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	ALG2	P43636	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	ENV7	Q12003	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	TIM23	P32897	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	CHA4	P43634	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	DAM1	P53267	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	LTE1	P07866	1435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	CIT2	P08679	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
HCA4	YJL033W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	PHO8	P11491	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	EMC3	P36039	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	CEP3	P40969	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
HCA4	YJL033W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	STE11	P23561	717 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	GDH3	P39708	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	GYP8	P43570	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	GCN2	P15442	1659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	LST4	P34239	828 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	FLR1	P38124	548 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	PLB1	P39105	664 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	HDA1	P53973	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	ESC8	Q08119	714 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	DRS2	P39524	1355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	MHP1	P43638	1398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	ROX1	P25042	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	NCS6	P53088	359 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	REH1	Q06709	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HCA4	YJL033W	FBP1	P09201	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	SED4	P25365	1065 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RPD3	P32561	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	SPC29	P33419	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
HCA4	YJL033W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	TMA10	Q06177	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	UPC2	Q12151	913 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RAD53	P22216	821 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	THI4	P32318	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	ATP25	Q03153	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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