RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	MRPS35	P53292	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	YLR415C	O13578	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	PRC1	P00729	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
SYS1	YJL004C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	DAL7	P21826	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	EMC3	P36039	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	SAK1	P38990	1142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	SSY5	P47002	699 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	DAM1	P53267	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	RSC3	Q06639	885 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	SAP190	P36123	1033 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	PCL5	P38794	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	REH1	Q06709	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	PFA3	P42836	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	TAD1	P53065	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	SGO1	Q08490	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	TDP1	P38319	544 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	SIC1	P38634	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	HUL4	P40985	892 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	CIT1	P00890	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	TOP3	P13099	656 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	RAD4	P14736	754 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	KIN3	P22209	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	FMP52	P40008	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	SNM1	P40993	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	SSL2	Q00578	843 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	IRC13	Q08630	104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	THI21	Q08975	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	PPZ2	P33329	710 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	YBR259W	P38338	688 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	TEL2	P53038	688 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYS1	YJL004C	DMC1	P25453	334 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	YCL002C	P25565	263 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	YIL166C	P40445	542 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	GYP8	P43570	497 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	TAH11	P47112	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	YAP1802	P53309	568 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	TAF8	Q03750	510 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	TGL5	Q12043	749 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	SUT2	Q12286	268 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	BCD1	P38772	366 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	SHR5	P41912	237 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	ALG2	P43636	503 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	TIM54	P47045	478 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	YJL049W	P47048	450 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	PEX2	P32800	271 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	IMO32	P53219	342 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	ATP25	Q03153	612 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	GAD1	Q04792	585 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	COQ11	Q05892	277 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	BNR1	P40450	1375 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	REV7	P38927	245 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	ECM1	P39715	212 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	HOS4	P40480	1083 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	UBC11	P52492	156 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	ZIP2	P53061	704 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	MET7	Q08645	548 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	DIF1	O13577	133 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	BAP3	P41815	604 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	YBP2	P53169	641 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	GPR1	Q12361	961 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	YJL206C	P39529	758 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	ASM4	Q05166	528 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	FLC1	Q08967	793 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SYS1	YJL004C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.46	□□□□□ -1.7	not detected
SYS1	YJL004C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
SYS1	YJL004C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7

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