RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W POL31P46957 487 aa9.89□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W SEC5P89102 971 aa9.89□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W CTF3Q12748 733 aa9.89□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W FMP27Q06179 2628 aa9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W FOB1O13329 566 aa9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W PCK1P10963 549 aa9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W FUS1P11710 512 aa9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W PEP7P32609 515 aa9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W RFC5P38251 354 aa9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W VTC2P43585 828 aa9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W ASN1P49089 572 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W PIL1P53252 339 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W YHM2Q04013 314 aa9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W ELG1Q12050 791 aa9.88□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W SSB1P11484 613 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W YHR054CP38780 354 aa9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W FMO1P38866 432 aa9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W SSB2P40150 613 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W DAK2P43550 591 aa9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W ZAP1P47043 880 aa9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W CAF120P53836 1060 aa9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W HOM2P13663 365 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W POL12P38121 705 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W FAA4P47912 694 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W PSP1P50896 841 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W CUE3P53137 624 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W YML053CQ04978 212 aa9.86□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W PGI1P12709 554 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W VPS25P47142 202 aa9.85□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data9.85□□□□□ -0.83not detected
CPD1YGR247W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W YDL057WQ07379 328 aa9.85□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W ASP3-2P0CX77 362 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W ASP3-3P0CX78 362 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W ASP3-4P0CX79 362 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W ASP3-1P0CZ17 362 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W MCM3P24279 971 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W SLA2P33338 968 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W TTI1P36097 1038 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W PPS1P38148 807 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W DUG2P38149 878 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W SFB3P38810 929 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W YPL277CQ08989 487 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W YPL150WQ12152 901 aa9.84□□□□□ -0.83
CPD1YGR247W PHO8P11491 566 aa9.83□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W GYP8P43570 497 aa9.83□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W LSB3P43603 459 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W RSM26P47141 266 aa9.83□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W CDD1Q06549 142 aa9.83□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W LAA1P39526 2014 aa9.83□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W CUP1-1P0CX80 61 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W CUP1-2P0CX81 61 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W URA1P28272 314 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W NEM1P38757 446 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W SNF7P39929 240 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W NPP2P39997 493 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W BIM1P40013 344 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W TGL3P40308 642 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W TUB4P53378 473 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W YNR061CP53747 219 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W TAF10Q12030 206 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W HRT3Q12347 344 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W MPD2Q99316 277 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W MSB2P32334 1306 aa9.82□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W TEL1P38110 2787 aa9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W NUM1Q00402 2748 aa9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W HIS4P00815 799 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W STE11P23561 717 aa9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W MRM1P25270 412 aa9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W YEL1P34225 687 aa9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W CDC27P38042 758 aa9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W MED6P38782 295 aa9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W NMD3P38861 518 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W YFL034WP43564 1073 aa9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W HSH155P49955 971 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W YPR084WQ06821 456 aa9.81□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W CET1O13297 549 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W TPK1P06244 397 aa9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W RGP1P16664 663 aa9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W SIR1P21691 654 aa9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W ISF1P32488 338 aa9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W BCH2P36122 765 aa9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W TBS1P38114 1094 aa9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W KTR4P38131 464 aa9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W YBL036CP38197 257 aa9.8□□□□□ -0.84
CPD1YGR247W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
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