RNA–Protein interactions for RNA: YGL064C

MRH4, Transcript of Mitochondrial ATP-dependent RNA helicase of the DEAD-box family, yeast

Gene MRH4, Length 1,686 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRH4	YGL064C	RNH70	P53331	553 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	MDM38	Q08179	573 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	SSP2	Q08646	371 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	ACE2	P21192	770 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	BET3	P36149	193 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	BUD6	P41697	788 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
MRH4	YGL064C	INP52	P50942	1183 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	HFM1	P51979	1187 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	RTA1	P53047	317 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	YNL050C	P53952	270 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRH4	YGL064C	NPP1	P25353	742 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	MTC3	P53077	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
MRH4	YGL064C	ERO1	Q03103	563 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	RSM24	Q03976	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	OSW2	Q12202	724 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	CMP2	P14747	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	OSW7	P43611	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SFB2	P53953	876 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	XYL2	Q07993	356 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	PPM2	Q08282	695 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	CTI6	Q08923	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	LYS2	P07702	1392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	GIC1	P38785	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	NPP2	P39997	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SRT1	Q03175	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	ALE1	Q08548	619 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
MRH4	YGL064C	PHO8	P11491	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	AFR1	P33304	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	DOM34	P33309	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	LRG1	P35688	1017 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SHC1	P39000	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	MAM1	P40065	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	LCD1	Q04377	747 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	IRC3	Q06683	689 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	ENA1	P13587	1091 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	THI4	P32318	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	TOK1	P40310	691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	ROT1	Q03691	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	GRX6	Q12438	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	DFG16	Q99234	619 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	PET10	P36139	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SIT1	P39980	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	YER158C	P40095	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	YGL082W	P53155	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	AIM44	Q99299	758 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
MRH4	YGL064C	PRD1	P25375	712 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	YKU70	P32807	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	REC104	P33323	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	GAL10	P04397	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	YAP1801	P38856	637 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	ALG12	P53730	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	ORC3	P54790	616 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRH4	YGL064C	SRM1	P21827	482 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	FUN30	P31380	1131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	SRP101	P32916	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	GYP7	P48365	746 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	GCV2	P49095	1034 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	UBP16	Q02863	499 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	SEG2	P34250	1132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	MSC2	Q03455	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRH4	YGL064C	TOP1	P04786	769 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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