RNA–Protein interactions for RNA: YFL060C

SNO3, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SNO3, Length 669 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SNO3	YFL060C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	RAD53	P22216	821 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	SAP190	P36123	1033 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	MOH1	P38191	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	SSY5	P47002	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	PKH1	Q03407	766 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	DLT1	Q04216	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	ALG7	P07286	448 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	YCL002C	P25565	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	GDH3	P39708	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	RSC3	Q06639	885 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	OMS1	Q06668	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	ELO3	P40319	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	BUD6	P41697	788 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	HXT16	P47185	567 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	AMA1	P50082	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	YLR415C	O13578	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	SAK1	P38990	1142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	SHR5	P41912	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	FRE5	Q08908	694 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	ACF2	Q12168	779 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNO3	YFL060C	DIF1	O13577	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	FKH2	P41813	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	PFA3	P42836	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	ZIP2	P53061	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	MRPS35	P53292	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	TIM44	Q01852	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	TRM13	Q12383	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	MTC2	P34246	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
SNO3	YFL060C	UBA2	P52488	636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	MAL11	P53048	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	NRG1	Q03125	231 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	ADY4	Q05955	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	MCH5	Q08777	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	GPR1	Q12361	961 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	MDM12	Q92328	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	SIC1	P38634	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	DAS1	P47005	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	MUP1	P50276	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	PER1	P25625	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	TIM23	P32897	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	YBR053C	P38235	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	YBR259W	P38338	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	YIR042C	P40586	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	ALY2	P47029	1046 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	STB4	P50104	949 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	ECM1	P39715	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	NUP82	P40368	713 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	GIS1	Q03833	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	GSY1	P23337	708 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	MCD4	P36051	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	PPS1	P38148	807 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	YHL017W	P38745	532 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	CAF16	P43569	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	OSW7	P43611	510 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	YJL163C	P46996	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	TMN2	Q04562	672 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNO3	YFL060C	PHO8	P11491	566 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	BNA2	P47125	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	YBP2	P53169	641 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	MUK1	Q02866	612 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	UGO1	Q03327	502 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	TGL5	Q12043	749 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	CDC9	P04819	755 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	MSH2	P25847	964 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	BAP3	P41815	604 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	STU2	P46675	888 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	RIA1	P53893	1110 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	ASM4	Q05166	528 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	CRR1	Q05790	422 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	HOS4	P40480	1083 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	IRC10	Q08118	586 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	CIT2	P08679	460 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	SDS3	P40505	327 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SNO3	YFL060C	YFL052W	P43551	465 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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