RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C DPH2P32461 534 aa7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C REC104P33323 182 aa7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YEL068CP39977 110 aa7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C TPA1P40032 644 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C DPH1P40487 425 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C ARC35P53731 342 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C TIM10P87108 93 aa7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C GRX3Q03835 250 aa7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YHM2Q04013 314 aa7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C NHX1Q04121 633 aa7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YDR344CQ05510 147 aa7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C KCS1Q12494 1050 aa7.26□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SEM1O94742 89 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C RPC53P25441 422 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C PER1P25625 357 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C PDC6P26263 563 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C NGG1P32494 702 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C ALG3P38179 458 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C PRE3P38624 215 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C BNA2P47125 453 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C PPT1P53043 513 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YNL058CP53947 316 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C LAP2Q10740 671 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C ARP7Q12406 477 aa7.25□□□□□ -1.25
SHO1YER118C TRK1P12685 1235 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C CDC48P25694 835 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C CDC12P32468 407 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SLA1P32790 1244 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C OAF3P36023 863 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C EBP2P36049 427 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C PPE1P38796 400 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C AXL2P38928 823 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C PNT1P38969 423 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C POP2P39008 433 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YIL166CP40445 542 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C AXL1P40851 1208 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SLS1P42900 643 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YNR040WP53736 256 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C VHS3Q08438 674 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C ENV7Q12003 364 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C NUR1Q12066 484 aa7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SHO1YER118C HTS1P07263 546 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C MIH1P23748 554 aa7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SPT23P35210 1082 aa7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C PGM2P37012 569 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C AHP1P38013 176 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SPC72P39723 622 aa7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C MXR1P40029 184 aa7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SBE2P42223 864 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SET2P46995 733 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C CCM1P48237 864 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C RNR4P49723 345 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YDR514CQ04408 483 aa7.23□□□□□ -1.25
SHO1YER118C MTF2P10849 440 aa7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C NPP1P25353 742 aa7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YCL049CP25577 312 aa7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C RPT3P33298 428 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C BYE1P36106 594 aa7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C HSL7P38274 827 aa7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C RPN10P38886 268 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SAW1P39735 261 aa7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YER156CP40093 338 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C MRPL13Q02204 264 aa7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C OMS1Q06668 471 aa7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C YCG1Q06680 1035 aa7.22□□□□□ -1.25
SHO1YER118C SNF1P06782 633 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C CDC16P09798 840 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C RED1P14291 827 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C PDX1P16451 410 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ORC2P32833 620 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C VRP1P37370 817 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C APM3P38153 483 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C LAM1P38851 1228 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C MAM1P40065 302 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YIL092WP40497 633 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C VID22Q05934 901 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C RSC2Q06488 889 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ADY3Q07732 790 aa7.21□□□□□ -1.26
SHO1YER118C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data7.21□□□□□ -1.26not detected
SHO1YER118C SES1P07284 462 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C GUK1P15454 187 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ATP12P22135 325 aa7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C PHO3P24031 467 aa7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C DBF4P32325 704 aa7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C FAT1P38225 669 aa7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YHR218WP38899 603 aa7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YJR124CP47159 448 aa7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C NIT3P49954 291 aa7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ENV11P53246 860 aa7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C TY1A-DR3Q12441 440 aa7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHO1YER118C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C MTH1P35198 433 aa7.19□□□□□ -1.26
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