RNA–Protein interactions for RNA: Q0115

BI3, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase, yeast

Gene BI3, Length 1,554 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI3	Q0115	TAD1	P53065	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	RSC3	Q06639	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	STE13	P33894	931 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	NIT3	P49954	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	DAM1	P53267	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	ATP25	Q03153	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	MTC2	P34246	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	BUL1	P48524	976 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	SRD1	P09007	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	RAD18	P10862	487 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YDR514C	Q04408	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YLR001C	Q07895	862 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YLR040C	Q07988	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	UPC2	Q12151	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	GSY1	P23337	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	SCT1	P32784	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	MCD4	P36051	919 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	HXT16	P47185	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YKR011C	Q02209	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	GUP2	Q08929	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	SUL1	P38359	859 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	UBA2	P52488	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YNL193W	P53870	558 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YOL073C	Q08232	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YOR022C	Q12204	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	SFP1	P32432	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	HAL9	Q12180	1030 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YDR338C	Q05497	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	REH1	Q06709	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI3	Q0115	SED4	P25365	1065 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	PCL2	P25693	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	CAF16	P43569	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	ALY2	P47029	1046 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	VPS30	Q02948	557 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	YML122C	Q03207	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	PRC1	P00729	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	MIH1	P23748	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	STE14	P32584	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	SAP190	P36123	1033 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	KTR4	P38131	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
BI3	Q0115	AIM14	P53109	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	FBP1	P09201	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	TSR4	P25040	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	ERG4	P25340	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	HLJ1	P48353	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	PUS2	P53167	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	SFL1	P20134	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	SHR5	P41912	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	MET13	P53128	600 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	YMR206W	Q03695	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	CRR1	Q05790	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	DIF1	O13577	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	HMG1	P12683	1054 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
BI3	Q0115	HOG1	P32485	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	GRX4	P32642	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	UBP12	P39538	1254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	THI21	Q08975	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	YEN1	P40028	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	STB4	P50104	949 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	ATG33	Q06485	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	THI73	Q07904	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	TRM13	Q12383	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	CTF8	P38877	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	MGS1	P40151	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	SDP1	P40479	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	NHX1	Q04121	633 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	TMN2	Q04562	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	ASM4	Q05166	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	MCH5	Q08777	521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	NUP145	P49687	1317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	YKR051W	P36142	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	GPG1	P53130	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	RNT1	Q02555	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BI3	Q0115	YLR149C	Q99296	730 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.9 ms