RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF131P52739 623 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 KDM1AO60341 852 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PCYT1AP49585 367 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 IQCEQ6IPM2 695 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NACA2Q9H009 215 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PALMDQ9NP74 551 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 STK24Q9Y6E0 443 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ARPC4P59998 168 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM58Q8NG06 486 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TULP2O00295 520 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 GFAPP14136 432 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TUBBP07437 444 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ATP11AP98196 1134 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC63Q8NA47 563 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CEP162Q5TB80 1403 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 FOSL1P15407 271 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TUBB4BP68371 445 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC158Q5M9N0 1113 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC43Q8N309 656 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SPAG5Q96R06 1193 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 IWS1Q96ST2 819 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 RBSNQ9H1K0 784 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF711Q9Y462 761 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MYZAPP0CAP1 466 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC174Q6PII3 467 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA1Q92805 767 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NEK1Q96PY6 1258 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 OPA1O60313 960 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MYBL2P10244 700 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 RASEFQ8IZ41 740 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCE1Q969G3 411 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PPFIA4O75335 1185 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SLC8A3P57103 927 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 GSDMDP57764 484 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF445P59923 1031 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 KRT72Q14CN4 511 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP58Q5T655 872 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CLTAP09496 248 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 BIRC3Q13489 604 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SPECC1Q5M775 1068 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PARVBQ9HBI1 364 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PPME1Q9Y570 386 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ZEB2O60315 1214 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TSPAN9O75954 239 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 FCHSD2O94868 740 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 GBP1P32455 592 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 VPS41P49754 854 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 RPS6KA3P51812 740 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA21Q7Z572 469 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 POLKQ9UBT6 870 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 HIP1RO75146 1068 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
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